Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtrP07309 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtrP07309 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtrP07309 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtrP07309 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtrP07309 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtrP07309 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtrP07309 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtrP07309 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtrP07309 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtrP07309 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtrP07309 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtrP07309 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtrP07309 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtrP07309 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtrP07309 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtrP07309 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtrP07309 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtrP07309 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtrP07309 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtrP07309 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TtrP07309 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtrP07309 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtrP07309 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtrP07309 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtrP07309 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtrP07309 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtrP07309 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtrP07309 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtrP07309 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtrP07309 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtrP07309 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TtrP07309 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TtrP07309 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TtrP07309 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtrP07309 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtrP07309 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtrP07309 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtrP07309 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TtrP07309 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TtrP07309 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TtrP07309 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TtrP07309 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TtrP07309 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TtrP07309 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TtrP07309 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TtrP07309 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtrP07309 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtrP07309 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtrP07309 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TtrP07309 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtrP07309 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TtrP07309 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TtrP07309 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TtrP07309 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TtrP07309 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TtrP07309 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TtrP07309 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TtrP07309 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TtrP07309 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TtrP07309 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TtrP07309 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtrP07309 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtrP07309 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtrP07309 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtrP07309 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtrP07309 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtrP07309 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TtrP07309 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TtrP07309 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TtrP07309 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TtrP07309 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtrP07309 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TtrP07309 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TtrP07309 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TtrP07309 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtrP07309 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtrP07309 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtrP07309 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtrP07309 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TtrP07309 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtrP07309 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtrP07309 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TtrP07309 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtrP07309 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtrP07309 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtrP07309 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtrP07309 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtrP07309 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TtrP07309 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TtrP07309 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TtrP07309 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TtrP07309 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TtrP07309 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtrP07309 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtrP07309 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtrP07309 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtrP07309 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtrP07309 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TtrP07309 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms