Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JunP05627 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JunP05627 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JunP05627 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JunP05627 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JunP05627 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JunP05627 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JunP05627 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
JunP05627 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
JunP05627 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
JunP05627 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JunP05627 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
JunP05627 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JunP05627 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JunP05627 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JunP05627 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JunP05627 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JunP05627 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JunP05627 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JunP05627 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JunP05627 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
JunP05627 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
JunP05627 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
JunP05627 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
JunP05627 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
JunP05627 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JunP05627 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JunP05627 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JunP05627 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
JunP05627 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JunP05627 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JunP05627 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
JunP05627 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
JunP05627 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
JunP05627 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JunP05627 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JunP05627 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JunP05627 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
JunP05627 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
JunP05627 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
JunP05627 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
JunP05627 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
JunP05627 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
JunP05627 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
JunP05627 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
JunP05627 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
JunP05627 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
JunP05627 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
JunP05627 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
JunP05627 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
JunP05627 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
JunP05627 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
JunP05627 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
JunP05627 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
JunP05627 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
JunP05627 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
JunP05627 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
JunP05627 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
JunP05627 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
JunP05627 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
JunP05627 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
JunP05627 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
JunP05627 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
JunP05627 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
JunP05627 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
JunP05627 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
JunP05627 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
JunP05627 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
JunP05627 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
JunP05627 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
JunP05627 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
JunP05627 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
JunP05627 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
JunP05627 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
JunP05627 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
JunP05627 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
JunP05627 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
JunP05627 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
JunP05627 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
JunP05627 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
JunP05627 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
JunP05627 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
JunP05627 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
JunP05627 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
JunP05627 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
JunP05627 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
JunP05627 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
JunP05627 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
JunP05627 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
JunP05627 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
JunP05627 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
JunP05627 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
JunP05627 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JunP05627 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JunP05627 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
JunP05627 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
JunP05627 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
JunP05627 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
JunP05627 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
JunP05627 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms