Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ItgamP05555 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ItgamP05555 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ItgamP05555 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ItgamP05555 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ItgamP05555 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ItgamP05555 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ItgamP05555 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ItgamP05555 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ItgamP05555 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ItgamP05555 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ItgamP05555 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ItgamP05555 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ItgamP05555 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ItgamP05555 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ItgamP05555 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ItgamP05555 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ItgamP05555 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ItgamP05555 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ItgamP05555 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ItgamP05555 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ItgamP05555 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ItgamP05555 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ItgamP05555 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ItgamP05555 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ItgamP05555 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ItgamP05555 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ItgamP05555 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ItgamP05555 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ItgamP05555 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ItgamP05555 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ItgamP05555 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ItgamP05555 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ItgamP05555 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ItgamP05555 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ItgamP05555 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ItgamP05555 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ItgamP05555 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ItgamP05555 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ItgamP05555 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ItgamP05555 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ItgamP05555 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ItgamP05555 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ItgamP05555 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ItgamP05555 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ItgamP05555 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ItgamP05555 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ItgamP05555 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ItgamP05555 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ItgamP05555 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ItgamP05555 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ItgamP05555 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ItgamP05555 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ItgamP05555 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgamP05555 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgamP05555 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgamP05555 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgamP05555 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgamP05555 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ItgamP05555 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ItgamP05555 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ItgamP05555 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ItgamP05555 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ItgamP05555 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ItgamP05555 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ItgamP05555 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ItgamP05555 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ItgamP05555 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ItgamP05555 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ItgamP05555 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ItgamP05555 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ItgamP05555 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ItgamP05555 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ItgamP05555 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ItgamP05555 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ItgamP05555 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ItgamP05555 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgamP05555 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ItgamP05555 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ItgamP05555 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ItgamP05555 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ItgamP05555 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgamP05555 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgamP05555 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgamP05555 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgamP05555 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgamP05555 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgamP05555 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgamP05555 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgamP05555 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgamP05555 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgamP05555 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgamP05555 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgamP05555 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ItgamP05555 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgamP05555 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgamP05555 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgamP05555 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgamP05555 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ItgamP05555 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.8 ms