Protein–RNA interactions for Protein: P05214

Tuba3a, Tubulin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba3aP05214 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tuba3aP05214 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tuba3aP05214 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tuba3aP05214 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tuba3aP05214 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tuba3aP05214 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tuba3aP05214 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tuba3aP05214 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tuba3aP05214 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tuba3aP05214 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tuba3aP05214 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tuba3aP05214 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tuba3aP05214 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tuba3aP05214 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tuba3aP05214 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tuba3aP05214 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tuba3aP05214 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tuba3aP05214 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tuba3aP05214 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tuba3aP05214 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tuba3aP05214 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tuba3aP05214 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tuba3aP05214 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tuba3aP05214 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tuba3aP05214 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tuba3aP05214 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tuba3aP05214 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tuba3aP05214 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tuba3aP05214 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tuba3aP05214 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tuba3aP05214 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tuba3aP05214 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tuba3aP05214 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tuba3aP05214 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tuba3aP05214 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tuba3aP05214 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tuba3aP05214 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tuba3aP05214 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tuba3aP05214 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tuba3aP05214 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tuba3aP05214 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tuba3aP05214 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tuba3aP05214 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tuba3aP05214 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tuba3aP05214 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tuba3aP05214 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tuba3aP05214 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tuba3aP05214 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tuba3aP05214 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tuba3aP05214 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tuba3aP05214 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tuba3aP05214 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tuba3aP05214 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tuba3aP05214 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tuba3aP05214 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tuba3aP05214 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tuba3aP05214 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tuba3aP05214 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tuba3aP05214 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tuba3aP05214 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tuba3aP05214 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tuba3aP05214 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tuba3aP05214 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tuba3aP05214 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tuba3aP05214 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tuba3aP05214 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tuba3aP05214 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tuba3aP05214 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tuba3aP05214 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tuba3aP05214 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tuba3aP05214 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tuba3aP05214 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tuba3aP05214 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tuba3aP05214 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tuba3aP05214 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tuba3aP05214 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tuba3aP05214 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tuba3aP05214 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tuba3aP05214 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tuba3aP05214 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tuba3aP05214 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms