Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01791 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01791 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01791 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01791 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01791 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01791 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01791 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01791 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01791 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01791 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01791 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01791 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01791 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01791 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01791 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01791 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01791 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01791 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01791 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01791 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01791 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01791 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01791 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01791 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01791 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01791 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01791 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01791 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01791 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01791 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01791 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01791 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01791 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01791 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01791 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01791 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01791 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01791 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01791 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01791 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01791 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01791 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01791 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01791 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01791 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01791 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01791 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01791 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01791 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01791 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01791 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01791 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01791 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01791 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01791 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P01791 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01791 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01791 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01791 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01791 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01791 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01791 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
P01791 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
P01791 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01791 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01791 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01791 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01791 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01791 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01791 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01791 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01791 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01791 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01791 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01791 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01791 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01791 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01791 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01791 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01791 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01791 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01791 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01791 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01791 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01791 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01791 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01791 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01791 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01791 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01791 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01791 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01791 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01791 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01791 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01791 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01791 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01791 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01791 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01791 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms