Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
P01662 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22,06■■□□□ 1,12
P01662 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22,06■■□□□ 1,12
P01662 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
P01662 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
P01662 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
P01662 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
P01662 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22,02■■□□□ 1,12
P01662 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22,02■■□□□ 1,11
P01662 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,01■■□□□ 1,11
P01662 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22■■□□□ 1,11
P01662 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
P01662 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,98■■□□□ 1,11
P01662 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
P01662 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
P01662 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
P01662 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21,97■■□□□ 1,11
P01662 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
P01662 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,96■■□□□ 1,11
P01662 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
P01662 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
P01662 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21,94■■□□□ 1,1
P01662 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21,94■■□□□ 1,1
P01662 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
P01662 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
P01662 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,93■■□□□ 1,1
P01662 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
P01662 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21,93■■□□□ 1,1
P01662 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
P01662 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
P01662 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,91■■□□□ 1,1
P01662 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
P01662 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
P01662 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
P01662 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
P01662 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
P01662 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,9■■□□□ 1,1
P01662 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
P01662 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
P01662 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
P01662 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
P01662 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
P01662 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
P01662 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,86■■□□□ 1,09
P01662 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
P01662 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
P01662 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
P01662 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
P01662 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
P01662 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
P01662 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
P01662 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
P01662 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
P01662 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21,81■■□□□ 1,08
P01662 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
P01662 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
P01662 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21,79■■□□□ 1,08
P01662 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
P01662 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
P01662 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
P01662 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
P01662 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
P01662 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21,76■■□□□ 1,07
P01662 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
P01662 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
P01662 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,75■■□□□ 1,07
P01662 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21,75■■□□□ 1,07
P01662 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
P01662 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
P01662 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
P01662 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
P01662 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
P01662 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
P01662 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
P01662 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
P01662 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
P01662 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
P01662 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
P01662 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
P01662 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
P01662 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21,7■■□□□ 1,06
P01662 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
P01662 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
P01662 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
P01662 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
P01662 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
P01662 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
P01662 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
P01662 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
P01662 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
P01662 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
P01662 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
P01662 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
P01662 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
P01662 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
P01662 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
P01662 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
P01662 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
P01662 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,62■■□□□ 1,05
P01662 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43,3 ms