Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mtatp6P00848 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mtatp6P00848 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mtatp6P00848 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mtatp6P00848 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mtatp6P00848 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mtatp6P00848 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mtatp6P00848 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mtatp6P00848 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mtatp6P00848 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Mtatp6P00848 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mtatp6P00848 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mtatp6P00848 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mtatp6P00848 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mtatp6P00848 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mtatp6P00848 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mtatp6P00848 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mtatp6P00848 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mtatp6P00848 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mtatp6P00848 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Mtatp6P00848 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mtatp6P00848 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mtatp6P00848 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mtatp6P00848 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtatp6P00848 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtatp6P00848 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtatp6P00848 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtatp6P00848 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mtatp6P00848 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mtatp6P00848 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mtatp6P00848 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mtatp6P00848 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mtatp6P00848 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Mtatp6P00848 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mtatp6P00848 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mtatp6P00848 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mtatp6P00848 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mtatp6P00848 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mtatp6P00848 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mtatp6P00848 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Mtatp6P00848 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mtatp6P00848 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mtatp6P00848 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mtatp6P00848 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mtatp6P00848 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mtatp6P00848 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mtatp6P00848 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mtatp6P00848 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtatp6P00848 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtatp6P00848 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtatp6P00848 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtatp6P00848 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtatp6P00848 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtatp6P00848 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtatp6P00848 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtatp6P00848 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtatp6P00848 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtatp6P00848 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtatp6P00848 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtatp6P00848 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mtatp6P00848 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mtatp6P00848 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtatp6P00848 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtatp6P00848 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mtatp6P00848 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mtatp6P00848 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mtatp6P00848 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mtatp6P00848 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mtatp6P00848 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mtatp6P00848 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mtatp6P00848 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mtatp6P00848 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mtatp6P00848 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mtatp6P00848 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mtatp6P00848 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mtatp6P00848 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mtatp6P00848 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mtatp6P00848 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mtatp6P00848 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mtatp6P00848 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtatp6P00848 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtatp6P00848 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtatp6P00848 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtatp6P00848 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtatp6P00848 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mtatp6P00848 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mtatp6P00848 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mtatp6P00848 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mtatp6P00848 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mtatp6P00848 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mtatp6P00848 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms