Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3pxd2aO89032 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3pxd2aO89032 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3pxd2aO89032 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3pxd2aO89032 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3pxd2aO89032 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3pxd2aO89032 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3pxd2aO89032 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3pxd2aO89032 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3pxd2aO89032 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3pxd2aO89032 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3pxd2aO89032 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3pxd2aO89032 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3pxd2aO89032 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3pxd2aO89032 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3pxd2aO89032 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3pxd2aO89032 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3pxd2aO89032 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3pxd2aO89032 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sh3pxd2aO89032 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3pxd2aO89032 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3pxd2aO89032 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3pxd2aO89032 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3pxd2aO89032 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3pxd2aO89032 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3pxd2aO89032 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3pxd2aO89032 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3pxd2aO89032 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3pxd2aO89032 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3pxd2aO89032 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3pxd2aO89032 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3pxd2aO89032 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3pxd2aO89032 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3pxd2aO89032 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3pxd2aO89032 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3pxd2aO89032 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3pxd2aO89032 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3pxd2aO89032 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3pxd2aO89032 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3pxd2aO89032 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3pxd2aO89032 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3pxd2aO89032 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3pxd2aO89032 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3pxd2aO89032 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3pxd2aO89032 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3pxd2aO89032 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3pxd2aO89032 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3pxd2aO89032 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3pxd2aO89032 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3pxd2aO89032 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3pxd2aO89032 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3pxd2aO89032 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3pxd2aO89032 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3pxd2aO89032 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3pxd2aO89032 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3pxd2aO89032 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3pxd2aO89032 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3pxd2aO89032 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3pxd2aO89032 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3pxd2aO89032 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3pxd2aO89032 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3pxd2aO89032 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3pxd2aO89032 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3pxd2aO89032 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3pxd2aO89032 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3pxd2aO89032 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3pxd2aO89032 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3pxd2aO89032 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3pxd2aO89032 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3pxd2aO89032 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3pxd2aO89032 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3pxd2aO89032 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3pxd2aO89032 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3pxd2aO89032 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3pxd2aO89032 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3pxd2aO89032 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3pxd2aO89032 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3pxd2aO89032 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms