Protein–RNA interactions for Protein: O89029

Matn4, Matrilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn4O89029 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Matn4O89029 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Matn4O89029 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Matn4O89029 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Matn4O89029 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Matn4O89029 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Matn4O89029 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Matn4O89029 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Matn4O89029 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Matn4O89029 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Matn4O89029 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Matn4O89029 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Matn4O89029 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Matn4O89029 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Matn4O89029 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Matn4O89029 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Matn4O89029 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Matn4O89029 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Matn4O89029 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Matn4O89029 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Matn4O89029 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Matn4O89029 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Matn4O89029 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Matn4O89029 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Matn4O89029 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Matn4O89029 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Matn4O89029 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Matn4O89029 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Matn4O89029 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Matn4O89029 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Matn4O89029 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Matn4O89029 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Matn4O89029 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Matn4O89029 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Matn4O89029 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Matn4O89029 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Matn4O89029 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Matn4O89029 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Matn4O89029 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Matn4O89029 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Matn4O89029 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Matn4O89029 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Matn4O89029 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Matn4O89029 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Matn4O89029 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Matn4O89029 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Matn4O89029 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Matn4O89029 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Matn4O89029 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Matn4O89029 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Matn4O89029 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Matn4O89029 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Matn4O89029 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Matn4O89029 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Matn4O89029 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Matn4O89029 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Matn4O89029 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Matn4O89029 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Matn4O89029 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Matn4O89029 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Matn4O89029 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Matn4O89029 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Matn4O89029 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Matn4O89029 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Matn4O89029 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Matn4O89029 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Matn4O89029 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Matn4O89029 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Matn4O89029 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Matn4O89029 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Matn4O89029 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Matn4O89029 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Matn4O89029 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Matn4O89029 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Matn4O89029 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Matn4O89029 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Matn4O89029 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Matn4O89029 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Matn4O89029 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Matn4O89029 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Matn4O89029 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Matn4O89029 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Matn4O89029 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Matn4O89029 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Matn4O89029 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Matn4O89029 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Matn4O89029 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Matn4O89029 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Matn4O89029 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Matn4O89029 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Matn4O89029 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Matn4O89029 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Matn4O89029 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Matn4O89029 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Matn4O89029 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Matn4O89029 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Matn4O89029 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Matn4O89029 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Matn4O89029 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Matn4O89029 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms