Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Actn3O88990 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Actn3O88990 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Actn3O88990 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Actn3O88990 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Actn3O88990 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Actn3O88990 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Actn3O88990 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Actn3O88990 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Actn3O88990 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Actn3O88990 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Actn3O88990 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Actn3O88990 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Actn3O88990 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Actn3O88990 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Actn3O88990 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Actn3O88990 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Actn3O88990 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Actn3O88990 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Actn3O88990 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Actn3O88990 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Actn3O88990 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Actn3O88990 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Actn3O88990 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Actn3O88990 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Actn3O88990 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Actn3O88990 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Actn3O88990 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Actn3O88990 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Actn3O88990 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Actn3O88990 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Actn3O88990 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Actn3O88990 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Actn3O88990 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Actn3O88990 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Actn3O88990 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Actn3O88990 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Actn3O88990 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Actn3O88990 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Actn3O88990 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Actn3O88990 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Actn3O88990 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Actn3O88990 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Actn3O88990 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Actn3O88990 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Actn3O88990 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Actn3O88990 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Actn3O88990 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Actn3O88990 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Actn3O88990 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Actn3O88990 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Actn3O88990 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Actn3O88990 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Actn3O88990 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Actn3O88990 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Actn3O88990 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Actn3O88990 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Actn3O88990 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Actn3O88990 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Actn3O88990 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Actn3O88990 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Actn3O88990 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Actn3O88990 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Actn3O88990 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Actn3O88990 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Actn3O88990 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Actn3O88990 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Actn3O88990 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Actn3O88990 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Actn3O88990 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Actn3O88990 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Actn3O88990 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Actn3O88990 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Actn3O88990 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Actn3O88990 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Actn3O88990 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Actn3O88990 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Actn3O88990 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Actn3O88990 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Actn3O88990 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Actn3O88990 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Actn3O88990 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Actn3O88990 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Actn3O88990 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Actn3O88990 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Actn3O88990 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Actn3O88990 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Actn3O88990 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Actn3O88990 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Actn3O88990 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Actn3O88990 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Actn3O88990 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Actn3O88990 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Actn3O88990 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Actn3O88990 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Actn3O88990 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Actn3O88990 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Actn3O88990 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Actn3O88990 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Actn3O88990 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms