Protein–RNA interactions for Protein: O88909

Slc22a8, Solute carrier family 22 member 8, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a8O88909 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc22a8O88909 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc22a8O88909 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc22a8O88909 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc22a8O88909 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc22a8O88909 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc22a8O88909 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc22a8O88909 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc22a8O88909 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc22a8O88909 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc22a8O88909 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc22a8O88909 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc22a8O88909 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc22a8O88909 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc22a8O88909 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc22a8O88909 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc22a8O88909 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc22a8O88909 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc22a8O88909 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc22a8O88909 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc22a8O88909 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc22a8O88909 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc22a8O88909 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc22a8O88909 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc22a8O88909 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc22a8O88909 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc22a8O88909 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc22a8O88909 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc22a8O88909 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc22a8O88909 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc22a8O88909 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc22a8O88909 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc22a8O88909 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc22a8O88909 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc22a8O88909 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc22a8O88909 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc22a8O88909 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc22a8O88909 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc22a8O88909 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc22a8O88909 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc22a8O88909 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc22a8O88909 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc22a8O88909 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc22a8O88909 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc22a8O88909 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc22a8O88909 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc22a8O88909 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc22a8O88909 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc22a8O88909 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc22a8O88909 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc22a8O88909 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc22a8O88909 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc22a8O88909 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc22a8O88909 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc22a8O88909 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc22a8O88909 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc22a8O88909 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc22a8O88909 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc22a8O88909 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc22a8O88909 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc22a8O88909 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc22a8O88909 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc22a8O88909 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc22a8O88909 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc22a8O88909 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc22a8O88909 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc22a8O88909 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc22a8O88909 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc22a8O88909 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc22a8O88909 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc22a8O88909 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc22a8O88909 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc22a8O88909 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc22a8O88909 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc22a8O88909 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc22a8O88909 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc22a8O88909 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc22a8O88909 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc22a8O88909 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc22a8O88909 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc22a8O88909 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc22a8O88909 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc22a8O88909 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc22a8O88909 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc22a8O88909 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc22a8O88909 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc22a8O88909 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc22a8O88909 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc22a8O88909 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc22a8O88909 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc22a8O88909 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc22a8O88909 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc22a8O88909 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc22a8O88909 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc22a8O88909 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc22a8O88909 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc22a8O88909 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc22a8O88909 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc22a8O88909 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc22a8O88909 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms