Protein–RNA interactions for Protein: O88848

Arl6, ADP-ribosylation factor-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6O88848 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arl6O88848 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arl6O88848 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arl6O88848 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arl6O88848 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arl6O88848 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arl6O88848 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arl6O88848 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arl6O88848 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arl6O88848 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arl6O88848 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arl6O88848 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arl6O88848 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arl6O88848 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arl6O88848 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl6O88848 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl6O88848 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl6O88848 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arl6O88848 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arl6O88848 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arl6O88848 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Arl6O88848 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arl6O88848 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arl6O88848 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arl6O88848 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arl6O88848 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl6O88848 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl6O88848 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl6O88848 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arl6O88848 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arl6O88848 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arl6O88848 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Arl6O88848 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arl6O88848 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arl6O88848 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arl6O88848 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arl6O88848 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arl6O88848 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arl6O88848 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arl6O88848 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arl6O88848 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arl6O88848 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arl6O88848 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arl6O88848 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arl6O88848 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arl6O88848 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arl6O88848 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arl6O88848 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arl6O88848 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arl6O88848 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arl6O88848 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arl6O88848 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arl6O88848 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arl6O88848 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arl6O88848 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arl6O88848 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arl6O88848 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arl6O88848 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arl6O88848 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arl6O88848 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arl6O88848 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arl6O88848 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arl6O88848 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arl6O88848 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arl6O88848 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arl6O88848 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arl6O88848 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arl6O88848 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arl6O88848 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arl6O88848 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arl6O88848 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arl6O88848 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arl6O88848 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl6O88848 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl6O88848 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl6O88848 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl6O88848 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl6O88848 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arl6O88848 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arl6O88848 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arl6O88848 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Arl6O88848 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Arl6O88848 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Arl6O88848 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arl6O88848 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arl6O88848 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arl6O88848 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arl6O88848 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Arl6O88848 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arl6O88848 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arl6O88848 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arl6O88848 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arl6O88848 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arl6O88848 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arl6O88848 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arl6O88848 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arl6O88848 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arl6O88848 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arl6O88848 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arl6O88848 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 516.5 ms