Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ShdO88834 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ShdO88834 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ShdO88834 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ShdO88834 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ShdO88834 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ShdO88834 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ShdO88834 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ShdO88834 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ShdO88834 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ShdO88834 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ShdO88834 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ShdO88834 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ShdO88834 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ShdO88834 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ShdO88834 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ShdO88834 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ShdO88834 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ShdO88834 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ShdO88834 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ShdO88834 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ShdO88834 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ShdO88834 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ShdO88834 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ShdO88834 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ShdO88834 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ShdO88834 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ShdO88834 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ShdO88834 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ShdO88834 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ShdO88834 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ShdO88834 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ShdO88834 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ShdO88834 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ShdO88834 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ShdO88834 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ShdO88834 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ShdO88834 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ShdO88834 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ShdO88834 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ShdO88834 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ShdO88834 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ShdO88834 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ShdO88834 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ShdO88834 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ShdO88834 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ShdO88834 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ShdO88834 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ShdO88834 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ShdO88834 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ShdO88834 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ShdO88834 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ShdO88834 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ShdO88834 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ShdO88834 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ShdO88834 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ShdO88834 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ShdO88834 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ShdO88834 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ShdO88834 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ShdO88834 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ShdO88834 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ShdO88834 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ShdO88834 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ShdO88834 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ShdO88834 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ShdO88834 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ShdO88834 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ShdO88834 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ShdO88834 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ShdO88834 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ShdO88834 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ShdO88834 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ShdO88834 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ShdO88834 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ShdO88834 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ShdO88834 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ShdO88834 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ShdO88834 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ShdO88834 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ShdO88834 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ShdO88834 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ShdO88834 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ShdO88834 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ShdO88834 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ShdO88834 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ShdO88834 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ShdO88834 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ShdO88834 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ShdO88834 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ShdO88834 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ShdO88834 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ShdO88834 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ShdO88834 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ShdO88834 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ShdO88834 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ShdO88834 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ShdO88834 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ShdO88834 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ShdO88834 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms