Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmx1bO88609 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmx1bO88609 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmx1bO88609 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmx1bO88609 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmx1bO88609 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmx1bO88609 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmx1bO88609 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmx1bO88609 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmx1bO88609 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmx1bO88609 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmx1bO88609 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmx1bO88609 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmx1bO88609 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmx1bO88609 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmx1bO88609 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmx1bO88609 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmx1bO88609 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmx1bO88609 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmx1bO88609 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmx1bO88609 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmx1bO88609 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmx1bO88609 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmx1bO88609 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmx1bO88609 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmx1bO88609 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmx1bO88609 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmx1bO88609 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmx1bO88609 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmx1bO88609 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmx1bO88609 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmx1bO88609 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmx1bO88609 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmx1bO88609 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmx1bO88609 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmx1bO88609 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmx1bO88609 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmx1bO88609 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmx1bO88609 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmx1bO88609 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmx1bO88609 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmx1bO88609 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmx1bO88609 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmx1bO88609 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmx1bO88609 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmx1bO88609 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmx1bO88609 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmx1bO88609 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmx1bO88609 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmx1bO88609 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmx1bO88609 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmx1bO88609 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmx1bO88609 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmx1bO88609 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmx1bO88609 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmx1bO88609 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmx1bO88609 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmx1bO88609 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmx1bO88609 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmx1bO88609 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmx1bO88609 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmx1bO88609 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmx1bO88609 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmx1bO88609 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmx1bO88609 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmx1bO88609 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmx1bO88609 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmx1bO88609 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmx1bO88609 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmx1bO88609 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmx1bO88609 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmx1bO88609 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmx1bO88609 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lmx1bO88609 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmx1bO88609 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmx1bO88609 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmx1bO88609 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmx1bO88609 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmx1bO88609 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmx1bO88609 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmx1bO88609 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmx1bO88609 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmx1bO88609 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmx1bO88609 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmx1bO88609 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmx1bO88609 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmx1bO88609 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmx1bO88609 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmx1bO88609 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmx1bO88609 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmx1bO88609 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmx1bO88609 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmx1bO88609 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmx1bO88609 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmx1bO88609 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmx1bO88609 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmx1bO88609 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmx1bO88609 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmx1bO88609 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmx1bO88609 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms