Protein–RNA interactions for Protein: O88472

Tnfrsf17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf17O88472 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfrsf17O88472 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfrsf17O88472 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf17O88472 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfrsf17O88472 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnfrsf17O88472 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfrsf17O88472 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf17O88472 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfrsf17O88472 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf17O88472 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfrsf17O88472 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf17O88472 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf17O88472 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf17O88472 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf17O88472 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfrsf17O88472 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfrsf17O88472 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfrsf17O88472 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf17O88472 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf17O88472 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf17O88472 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfrsf17O88472 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfrsf17O88472 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfrsf17O88472 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf17O88472 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf17O88472 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf17O88472 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf17O88472 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf17O88472 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf17O88472 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf17O88472 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf17O88472 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf17O88472 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf17O88472 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfrsf17O88472 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfrsf17O88472 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfrsf17O88472 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfrsf17O88472 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf17O88472 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf17O88472 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf17O88472 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf17O88472 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf17O88472 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf17O88472 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf17O88472 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf17O88472 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf17O88472 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf17O88472 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf17O88472 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf17O88472 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf17O88472 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf17O88472 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfrsf17O88472 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfrsf17O88472 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfrsf17O88472 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf17O88472 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf17O88472 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf17O88472 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf17O88472 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf17O88472 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf17O88472 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf17O88472 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf17O88472 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf17O88472 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf17O88472 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf17O88472 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf17O88472 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf17O88472 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf17O88472 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnfrsf17O88472 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnfrsf17O88472 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf17O88472 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf17O88472 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf17O88472 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf17O88472 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf17O88472 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf17O88472 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf17O88472 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf17O88472 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf17O88472 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf17O88472 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf17O88472 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf17O88472 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf17O88472 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf17O88472 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf17O88472 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf17O88472 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf17O88472 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf17O88472 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf17O88472 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf17O88472 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf17O88472 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf17O88472 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf17O88472 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf17O88472 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf17O88472 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf17O88472 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf17O88472 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf17O88472 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf17O88472 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms