Protein–RNA interactions for Protein: O70477

Pknox1, Homeobox protein PKNOX1, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox1O70477 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pknox1O70477 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pknox1O70477 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pknox1O70477 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pknox1O70477 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pknox1O70477 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pknox1O70477 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pknox1O70477 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pknox1O70477 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pknox1O70477 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pknox1O70477 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pknox1O70477 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pknox1O70477 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pknox1O70477 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pknox1O70477 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pknox1O70477 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pknox1O70477 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pknox1O70477 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pknox1O70477 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pknox1O70477 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pknox1O70477 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pknox1O70477 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pknox1O70477 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pknox1O70477 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pknox1O70477 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pknox1O70477 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pknox1O70477 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pknox1O70477 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pknox1O70477 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pknox1O70477 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pknox1O70477 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pknox1O70477 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pknox1O70477 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pknox1O70477 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pknox1O70477 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pknox1O70477 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pknox1O70477 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pknox1O70477 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pknox1O70477 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pknox1O70477 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pknox1O70477 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pknox1O70477 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pknox1O70477 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pknox1O70477 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pknox1O70477 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pknox1O70477 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pknox1O70477 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pknox1O70477 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pknox1O70477 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pknox1O70477 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pknox1O70477 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pknox1O70477 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pknox1O70477 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pknox1O70477 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pknox1O70477 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pknox1O70477 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pknox1O70477 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pknox1O70477 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pknox1O70477 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pknox1O70477 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pknox1O70477 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pknox1O70477 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pknox1O70477 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pknox1O70477 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pknox1O70477 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pknox1O70477 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pknox1O70477 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pknox1O70477 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pknox1O70477 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pknox1O70477 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pknox1O70477 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pknox1O70477 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pknox1O70477 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pknox1O70477 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pknox1O70477 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pknox1O70477 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pknox1O70477 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pknox1O70477 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pknox1O70477 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pknox1O70477 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms