Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top3aO70157 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top3aO70157 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top3aO70157 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top3aO70157 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top3aO70157 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Top3aO70157 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Top3aO70157 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Top3aO70157 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top3aO70157 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top3aO70157 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top3aO70157 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top3aO70157 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top3aO70157 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top3aO70157 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top3aO70157 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top3aO70157 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top3aO70157 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top3aO70157 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top3aO70157 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top3aO70157 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top3aO70157 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top3aO70157 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top3aO70157 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top3aO70157 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top3aO70157 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top3aO70157 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top3aO70157 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top3aO70157 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top3aO70157 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top3aO70157 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top3aO70157 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top3aO70157 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top3aO70157 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top3aO70157 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Top3aO70157 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top3aO70157 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top3aO70157 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top3aO70157 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top3aO70157 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top3aO70157 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Top3aO70157 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top3aO70157 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top3aO70157 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top3aO70157 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top3aO70157 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top3aO70157 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top3aO70157 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top3aO70157 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top3aO70157 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top3aO70157 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top3aO70157 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top3aO70157 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top3aO70157 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top3aO70157 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top3aO70157 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Top3aO70157 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Top3aO70157 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top3aO70157 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top3aO70157 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top3aO70157 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top3aO70157 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Top3aO70157 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top3aO70157 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top3aO70157 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Top3aO70157 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top3aO70157 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top3aO70157 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top3aO70157 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top3aO70157 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Top3aO70157 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top3aO70157 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Top3aO70157 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top3aO70157 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top3aO70157 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top3aO70157 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top3aO70157 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top3aO70157 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top3aO70157 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top3aO70157 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top3aO70157 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top3aO70157 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top3aO70157 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Top3aO70157 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top3aO70157 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top3aO70157 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top3aO70157 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top3aO70157 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top3aO70157 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top3aO70157 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top3aO70157 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Top3aO70157 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top3aO70157 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top3aO70157 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top3aO70157 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top3aO70157 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top3aO70157 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top3aO70157 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top3aO70157 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top3aO70157 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms