Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HcrtO55241 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HcrtO55241 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HcrtO55241 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HcrtO55241 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HcrtO55241 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HcrtO55241 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HcrtO55241 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HcrtO55241 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HcrtO55241 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HcrtO55241 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HcrtO55241 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HcrtO55241 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HcrtO55241 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HcrtO55241 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HcrtO55241 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HcrtO55241 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HcrtO55241 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HcrtO55241 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HcrtO55241 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HcrtO55241 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HcrtO55241 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HcrtO55241 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HcrtO55241 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HcrtO55241 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HcrtO55241 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HcrtO55241 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HcrtO55241 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HcrtO55241 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HcrtO55241 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HcrtO55241 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HcrtO55241 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HcrtO55241 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HcrtO55241 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HcrtO55241 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HcrtO55241 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HcrtO55241 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HcrtO55241 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HcrtO55241 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HcrtO55241 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HcrtO55241 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HcrtO55241 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HcrtO55241 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HcrtO55241 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HcrtO55241 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HcrtO55241 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HcrtO55241 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HcrtO55241 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HcrtO55241 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HcrtO55241 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HcrtO55241 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HcrtO55241 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HcrtO55241 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HcrtO55241 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HcrtO55241 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HcrtO55241 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HcrtO55241 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HcrtO55241 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HcrtO55241 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HcrtO55241 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HcrtO55241 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HcrtO55241 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HcrtO55241 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HcrtO55241 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HcrtO55241 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HcrtO55241 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HcrtO55241 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HcrtO55241 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HcrtO55241 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HcrtO55241 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HcrtO55241 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HcrtO55241 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HcrtO55241 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HcrtO55241 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HcrtO55241 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HcrtO55241 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HcrtO55241 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HcrtO55241 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HcrtO55241 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HcrtO55241 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HcrtO55241 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HcrtO55241 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HcrtO55241 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HcrtO55241 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HcrtO55241 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HcrtO55241 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HcrtO55241 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HcrtO55241 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HcrtO55241 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HcrtO55241 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HcrtO55241 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HcrtO55241 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HcrtO55241 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HcrtO55241 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HcrtO55241 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HcrtO55241 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HcrtO55241 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HcrtO55241 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HcrtO55241 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HcrtO55241 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms