Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Supt5hO55201 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Supt5hO55201 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Supt5hO55201 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Supt5hO55201 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Supt5hO55201 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Supt5hO55201 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Supt5hO55201 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Supt5hO55201 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Supt5hO55201 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Supt5hO55201 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Supt5hO55201 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Supt5hO55201 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Supt5hO55201 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Supt5hO55201 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Supt5hO55201 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Supt5hO55201 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Supt5hO55201 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Supt5hO55201 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Supt5hO55201 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Supt5hO55201 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.26
Supt5hO55201 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Supt5hO55201 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Supt5hO55201 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Supt5hO55201 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Supt5hO55201 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Supt5hO55201 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Supt5hO55201 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Supt5hO55201 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Supt5hO55201 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Supt5hO55201 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Supt5hO55201 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Supt5hO55201 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Supt5hO55201 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Supt5hO55201 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Supt5hO55201 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Supt5hO55201 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Supt5hO55201 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Supt5hO55201 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Supt5hO55201 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Supt5hO55201 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Supt5hO55201 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Supt5hO55201 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Supt5hO55201 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Supt5hO55201 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Supt5hO55201 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Supt5hO55201 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Supt5hO55201 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Supt5hO55201 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Supt5hO55201 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Supt5hO55201 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Supt5hO55201 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Supt5hO55201 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Supt5hO55201 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Supt5hO55201 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Supt5hO55201 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Supt5hO55201 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Supt5hO55201 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Supt5hO55201 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Supt5hO55201 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Supt5hO55201 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Supt5hO55201 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Supt5hO55201 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Supt5hO55201 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Supt5hO55201 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Supt5hO55201 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Supt5hO55201 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Supt5hO55201 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Supt5hO55201 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Supt5hO55201 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Supt5hO55201 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Supt5hO55201 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Supt5hO55201 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Supt5hO55201 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Supt5hO55201 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Supt5hO55201 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Supt5hO55201 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Supt5hO55201 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Supt5hO55201 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Supt5hO55201 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Supt5hO55201 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
Supt5hO55201 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Supt5hO55201 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Supt5hO55201 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Supt5hO55201 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Supt5hO55201 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Supt5hO55201 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Supt5hO55201 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Supt5hO55201 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Supt5hO55201 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Supt5hO55201 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Supt5hO55201 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Supt5hO55201 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Supt5hO55201 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Supt5hO55201 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Supt5hO55201 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Supt5hO55201 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Supt5hO55201 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Supt5hO55201 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Supt5hO55201 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms