Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21,79■■□□□ 1,08
NlkO54949 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
NlkO54949 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
NlkO54949 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
NlkO54949 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
NlkO54949 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
NlkO54949 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21,77■■□□□ 1,08
NlkO54949 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21,77■■□□□ 1,08
NlkO54949 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
NlkO54949 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21,75■■□□□ 1,07
NlkO54949 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
NlkO54949 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
NlkO54949 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
NlkO54949 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
NlkO54949 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,74■■□□□ 1,07
NlkO54949 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
NlkO54949 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,74■■□□□ 1,07
NlkO54949 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
NlkO54949 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21,72■■□□□ 1,07
NlkO54949 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
NlkO54949 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
NlkO54949 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
NlkO54949 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,71■■□□□ 1,07
NlkO54949 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21,7■■□□□ 1,06
NlkO54949 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21,7■■□□□ 1,06
NlkO54949 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
NlkO54949 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,7■■□□□ 1,06
NlkO54949 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21,69■■□□□ 1,06
NlkO54949 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,69■■□□□ 1,06
NlkO54949 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
NlkO54949 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21,68■■□□□ 1,06
NlkO54949 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
NlkO54949 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
NlkO54949 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
NlkO54949 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
NlkO54949 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
NlkO54949 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
NlkO54949 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
NlkO54949 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
NlkO54949 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21,64■■□□□ 1,05
NlkO54949 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
NlkO54949 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
NlkO54949 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
NlkO54949 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
NlkO54949 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
NlkO54949 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
NlkO54949 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
NlkO54949 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
NlkO54949 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
NlkO54949 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21,59■■□□□ 1,05
NlkO54949 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21,58■■□□□ 1,05
NlkO54949 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21,58■■□□□ 1,05
NlkO54949 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
NlkO54949 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
NlkO54949 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
NlkO54949 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
NlkO54949 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
NlkO54949 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
NlkO54949 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
NlkO54949 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
NlkO54949 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
NlkO54949 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
NlkO54949 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,55■■□□□ 1,04
NlkO54949 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,54■■□□□ 1,04
NlkO54949 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
NlkO54949 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
NlkO54949 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
NlkO54949 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,03
NlkO54949 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,51■■□□□ 1,03
NlkO54949 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
NlkO54949 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
NlkO54949 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
NlkO54949 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
NlkO54949 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
NlkO54949 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21,49■■□□□ 1,03
NlkO54949 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
NlkO54949 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
NlkO54949 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
NlkO54949 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
NlkO54949 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21,47■■□□□ 1,03
NlkO54949 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
NlkO54949 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,46■■□□□ 1,03
NlkO54949 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,03
NlkO54949 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,45■■□□□ 1,02
NlkO54949 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21,45■■□□□ 1,02
NlkO54949 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
NlkO54949 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
NlkO54949 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
NlkO54949 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
NlkO54949 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
NlkO54949 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
NlkO54949 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21,43■■□□□ 1,02
NlkO54949 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
NlkO54949 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
NlkO54949 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,42■■□□□ 1,02
NlkO54949 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
NlkO54949 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,41■■□□□ 1,02
NlkO54949 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
NlkO54949 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
NlkO54949 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,2 ms