Protein–RNA interactions for Protein: O54830

Prl7a1, Prolactin-7A1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl7a1O54830 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl7a1O54830 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prl7a1O54830 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prl7a1O54830 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prl7a1O54830 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prl7a1O54830 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prl7a1O54830 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prl7a1O54830 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prl7a1O54830 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prl7a1O54830 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prl7a1O54830 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prl7a1O54830 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prl7a1O54830 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prl7a1O54830 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prl7a1O54830 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prl7a1O54830 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prl7a1O54830 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prl7a1O54830 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prl7a1O54830 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prl7a1O54830 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prl7a1O54830 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prl7a1O54830 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prl7a1O54830 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prl7a1O54830 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prl7a1O54830 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prl7a1O54830 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prl7a1O54830 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prl7a1O54830 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prl7a1O54830 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prl7a1O54830 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prl7a1O54830 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prl7a1O54830 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prl7a1O54830 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prl7a1O54830 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prl7a1O54830 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prl7a1O54830 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prl7a1O54830 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prl7a1O54830 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prl7a1O54830 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prl7a1O54830 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prl7a1O54830 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prl7a1O54830 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prl7a1O54830 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Prl7a1O54830 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prl7a1O54830 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prl7a1O54830 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prl7a1O54830 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prl7a1O54830 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prl7a1O54830 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prl7a1O54830 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prl7a1O54830 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prl7a1O54830 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prl7a1O54830 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prl7a1O54830 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prl7a1O54830 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prl7a1O54830 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prl7a1O54830 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prl7a1O54830 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prl7a1O54830 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms