Protein–RNA interactions for Protein: O54828

Rgs9, Regulator of G-protein signaling 9, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rgs9O54828 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Rgs9O54828 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Rgs9O54828 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Rgs9O54828 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Rgs9O54828 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Rgs9O54828 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Rgs9O54828 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Rgs9O54828 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Rgs9O54828 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Rgs9O54828 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Rgs9O54828 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Rgs9O54828 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Rgs9O54828 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Rgs9O54828 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Rgs9O54828 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Rgs9O54828 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Rgs9O54828 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Rgs9O54828 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Rgs9O54828 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Rgs9O54828 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Rgs9O54828 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Rgs9O54828 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Rgs9O54828 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Rgs9O54828 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Rgs9O54828 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Rgs9O54828 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,19
Rgs9O54828 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Rgs9O54828 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Rgs9O54828 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Rgs9O54828 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Rgs9O54828 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Rgs9O54828 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
Rgs9O54828 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Rgs9O54828 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Rgs9O54828 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Rgs9O54828 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Rgs9O54828 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rgs9O54828 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rgs9O54828 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rgs9O54828 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rgs9O54828 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rgs9O54828 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Rgs9O54828 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Rgs9O54828 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Rgs9O54828 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Rgs9O54828 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Rgs9O54828 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Rgs9O54828 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Rgs9O54828 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Rgs9O54828 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Rgs9O54828 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Rgs9O54828 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Rgs9O54828 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Rgs9O54828 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Rgs9O54828 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Rgs9O54828 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Rgs9O54828 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Rgs9O54828 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Rgs9O54828 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Rgs9O54828 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Rgs9O54828 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Rgs9O54828 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Rgs9O54828 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Rgs9O54828 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Rgs9O54828 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Rgs9O54828 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Rgs9O54828 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Rgs9O54828 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Rgs9O54828 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Rgs9O54828 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Rgs9O54828 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Rgs9O54828 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Rgs9O54828 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Rgs9O54828 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Rgs9O54828 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Rgs9O54828 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Rgs9O54828 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Rgs9O54828 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Rgs9O54828 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Rgs9O54828 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Rgs9O54828 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Rgs9O54828 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Rgs9O54828 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
Rgs9O54828 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Rgs9O54828 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Rgs9O54828 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Rgs9O54828 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Rgs9O54828 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Rgs9O54828 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Rgs9O54828 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Rgs9O54828 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Rgs9O54828 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Rgs9O54828 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Rgs9O54828 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,12
Rgs9O54828 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Rgs9O54828 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Rgs9O54828 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Rgs9O54828 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Rgs9O54828 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Rgs9O54828 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,9 ms