Protein–RNA interactions for Protein: O54774

Ap3d1, AP-3 complex subunit delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3d1O54774 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ap3d1O54774 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3d1O54774 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3d1O54774 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ap3d1O54774 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3d1O54774 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3d1O54774 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3d1O54774 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3d1O54774 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3d1O54774 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3d1O54774 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap3d1O54774 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3d1O54774 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3d1O54774 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3d1O54774 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3d1O54774 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ap3d1O54774 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3d1O54774 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3d1O54774 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3d1O54774 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3d1O54774 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3d1O54774 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap3d1O54774 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ap3d1O54774 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3d1O54774 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3d1O54774 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3d1O54774 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap3d1O54774 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ap3d1O54774 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3d1O54774 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3d1O54774 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3d1O54774 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3d1O54774 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3d1O54774 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3d1O54774 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3d1O54774 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3d1O54774 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3d1O54774 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3d1O54774 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3d1O54774 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ap3d1O54774 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ap3d1O54774 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ap3d1O54774 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap3d1O54774 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap3d1O54774 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3d1O54774 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3d1O54774 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3d1O54774 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3d1O54774 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3d1O54774 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ap3d1O54774 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3d1O54774 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3d1O54774 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3d1O54774 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3d1O54774 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ap3d1O54774 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ap3d1O54774 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ap3d1O54774 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap3d1O54774 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3d1O54774 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3d1O54774 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3d1O54774 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3d1O54774 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3d1O54774 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3d1O54774 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3d1O54774 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap3d1O54774 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3d1O54774 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3d1O54774 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3d1O54774 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3d1O54774 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3d1O54774 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3d1O54774 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3d1O54774 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3d1O54774 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3d1O54774 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3d1O54774 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3d1O54774 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3d1O54774 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3d1O54774 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3d1O54774 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3d1O54774 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3d1O54774 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3d1O54774 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3d1O54774 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap3d1O54774 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3d1O54774 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3d1O54774 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3d1O54774 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3d1O54774 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ap3d1O54774 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3d1O54774 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3d1O54774 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3d1O54774 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3d1O54774 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3d1O54774 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ap3d1O54774 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ap3d1O54774 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ap3d1O54774 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ap3d1O54774 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms