Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lhx8O35652 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lhx8O35652 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lhx8O35652 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lhx8O35652 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lhx8O35652 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lhx8O35652 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lhx8O35652 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lhx8O35652 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lhx8O35652 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lhx8O35652 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lhx8O35652 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lhx8O35652 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lhx8O35652 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lhx8O35652 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lhx8O35652 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lhx8O35652 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lhx8O35652 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lhx8O35652 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lhx8O35652 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lhx8O35652 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lhx8O35652 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lhx8O35652 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lhx8O35652 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lhx8O35652 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lhx8O35652 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lhx8O35652 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lhx8O35652 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lhx8O35652 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lhx8O35652 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lhx8O35652 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lhx8O35652 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lhx8O35652 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lhx8O35652 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lhx8O35652 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lhx8O35652 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lhx8O35652 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lhx8O35652 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lhx8O35652 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lhx8O35652 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lhx8O35652 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lhx8O35652 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lhx8O35652 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lhx8O35652 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lhx8O35652 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lhx8O35652 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lhx8O35652 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lhx8O35652 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lhx8O35652 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lhx8O35652 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lhx8O35652 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lhx8O35652 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lhx8O35652 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lhx8O35652 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lhx8O35652 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lhx8O35652 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lhx8O35652 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lhx8O35652 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lhx8O35652 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lhx8O35652 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lhx8O35652 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lhx8O35652 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lhx8O35652 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lhx8O35652 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lhx8O35652 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lhx8O35652 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lhx8O35652 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lhx8O35652 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lhx8O35652 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lhx8O35652 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lhx8O35652 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lhx8O35652 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lhx8O35652 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lhx8O35652 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lhx8O35652 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lhx8O35652 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lhx8O35652 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lhx8O35652 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lhx8O35652 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lhx8O35652 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lhx8O35652 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms