Protein–RNA interactions for Protein: O35609

Scamp3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp3O35609 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scamp3O35609 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scamp3O35609 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scamp3O35609 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scamp3O35609 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scamp3O35609 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Scamp3O35609 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Scamp3O35609 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scamp3O35609 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scamp3O35609 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scamp3O35609 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scamp3O35609 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scamp3O35609 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scamp3O35609 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scamp3O35609 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scamp3O35609 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scamp3O35609 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scamp3O35609 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scamp3O35609 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scamp3O35609 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scamp3O35609 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scamp3O35609 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scamp3O35609 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scamp3O35609 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scamp3O35609 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scamp3O35609 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scamp3O35609 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scamp3O35609 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scamp3O35609 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scamp3O35609 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scamp3O35609 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scamp3O35609 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scamp3O35609 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scamp3O35609 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scamp3O35609 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scamp3O35609 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scamp3O35609 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scamp3O35609 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scamp3O35609 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scamp3O35609 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Scamp3O35609 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scamp3O35609 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scamp3O35609 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scamp3O35609 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scamp3O35609 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scamp3O35609 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scamp3O35609 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scamp3O35609 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scamp3O35609 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Scamp3O35609 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scamp3O35609 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scamp3O35609 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scamp3O35609 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scamp3O35609 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scamp3O35609 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scamp3O35609 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scamp3O35609 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scamp3O35609 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scamp3O35609 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scamp3O35609 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scamp3O35609 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scamp3O35609 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scamp3O35609 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scamp3O35609 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scamp3O35609 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scamp3O35609 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scamp3O35609 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scamp3O35609 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scamp3O35609 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scamp3O35609 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scamp3O35609 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scamp3O35609 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Scamp3O35609 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scamp3O35609 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scamp3O35609 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scamp3O35609 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scamp3O35609 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scamp3O35609 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scamp3O35609 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Scamp3O35609 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scamp3O35609 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scamp3O35609 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Scamp3O35609 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scamp3O35609 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scamp3O35609 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scamp3O35609 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scamp3O35609 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scamp3O35609 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scamp3O35609 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scamp3O35609 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scamp3O35609 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scamp3O35609 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scamp3O35609 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scamp3O35609 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scamp3O35609 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scamp3O35609 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scamp3O35609 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scamp3O35609 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scamp3O35609 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scamp3O35609 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms