Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rabep1O35551 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rabep1O35551 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rabep1O35551 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rabep1O35551 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rabep1O35551 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Rabep1O35551 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rabep1O35551 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rabep1O35551 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rabep1O35551 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rabep1O35551 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Rabep1O35551 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rabep1O35551 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rabep1O35551 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rabep1O35551 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rabep1O35551 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rabep1O35551 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rabep1O35551 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rabep1O35551 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Rabep1O35551 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rabep1O35551 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rabep1O35551 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rabep1O35551 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rabep1O35551 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Rabep1O35551 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rabep1O35551 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rabep1O35551 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rabep1O35551 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rabep1O35551 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rabep1O35551 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rabep1O35551 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rabep1O35551 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rabep1O35551 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rabep1O35551 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rabep1O35551 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rabep1O35551 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rabep1O35551 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rabep1O35551 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rabep1O35551 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rabep1O35551 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rabep1O35551 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rabep1O35551 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rabep1O35551 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rabep1O35551 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rabep1O35551 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rabep1O35551 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rabep1O35551 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rabep1O35551 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rabep1O35551 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rabep1O35551 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rabep1O35551 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rabep1O35551 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rabep1O35551 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rabep1O35551 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rabep1O35551 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rabep1O35551 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Rabep1O35551 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rabep1O35551 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rabep1O35551 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Rabep1O35551 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Rabep1O35551 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rabep1O35551 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rabep1O35551 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rabep1O35551 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rabep1O35551 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rabep1O35551 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rabep1O35551 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rabep1O35551 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rabep1O35551 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Rabep1O35551 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rabep1O35551 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rabep1O35551 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rabep1O35551 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rabep1O35551 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rabep1O35551 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rabep1O35551 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rabep1O35551 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rabep1O35551 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rabep1O35551 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rabep1O35551 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rabep1O35551 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rabep1O35551 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rabep1O35551 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rabep1O35551 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rabep1O35551 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rabep1O35551 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rabep1O35551 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rabep1O35551 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rabep1O35551 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rabep1O35551 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rabep1O35551 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rabep1O35551 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rabep1O35551 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rabep1O35551 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rabep1O35551 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Rabep1O35551 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rabep1O35551 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rabep1O35551 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rabep1O35551 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rabep1O35551 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms