Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stx1aO35526 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stx1aO35526 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stx1aO35526 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stx1aO35526 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stx1aO35526 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stx1aO35526 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stx1aO35526 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stx1aO35526 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stx1aO35526 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stx1aO35526 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stx1aO35526 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stx1aO35526 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stx1aO35526 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stx1aO35526 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stx1aO35526 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stx1aO35526 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stx1aO35526 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Stx1aO35526 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Stx1aO35526 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Stx1aO35526 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Stx1aO35526 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stx1aO35526 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stx1aO35526 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stx1aO35526 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stx1aO35526 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stx1aO35526 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stx1aO35526 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stx1aO35526 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Stx1aO35526 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Stx1aO35526 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stx1aO35526 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stx1aO35526 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stx1aO35526 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stx1aO35526 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stx1aO35526 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stx1aO35526 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stx1aO35526 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stx1aO35526 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Stx1aO35526 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stx1aO35526 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stx1aO35526 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stx1aO35526 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stx1aO35526 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stx1aO35526 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stx1aO35526 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stx1aO35526 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stx1aO35526 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stx1aO35526 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stx1aO35526 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stx1aO35526 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stx1aO35526 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stx1aO35526 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stx1aO35526 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stx1aO35526 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Stx1aO35526 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Stx1aO35526 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Stx1aO35526 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Stx1aO35526 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Stx1aO35526 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Stx1aO35526 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Stx1aO35526 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stx1aO35526 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Stx1aO35526 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stx1aO35526 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stx1aO35526 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stx1aO35526 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stx1aO35526 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stx1aO35526 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stx1aO35526 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stx1aO35526 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stx1aO35526 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Stx1aO35526 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stx1aO35526 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stx1aO35526 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stx1aO35526 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stx1aO35526 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Stx1aO35526 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stx1aO35526 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stx1aO35526 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stx1aO35526 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stx1aO35526 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stx1aO35526 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stx1aO35526 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stx1aO35526 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stx1aO35526 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Stx1aO35526 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stx1aO35526 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Stx1aO35526 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Stx1aO35526 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Stx1aO35526 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Stx1aO35526 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stx1aO35526 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stx1aO35526 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stx1aO35526 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stx1aO35526 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stx1aO35526 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stx1aO35526 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stx1aO35526 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stx1aO35526 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms