Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1dO35473 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1dO35473 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1dO35473 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1dO35473 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1dO35473 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1dO35473 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1dO35473 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1dO35473 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1dO35473 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1dO35473 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1dO35473 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1dO35473 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1dO35473 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1dO35473 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1dO35473 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1dO35473 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1dO35473 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1dO35473 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1dO35473 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1dO35473 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1dO35473 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1dO35473 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1dO35473 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1dO35473 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1dO35473 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C1dO35473 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1dO35473 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1dO35473 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1dO35473 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1dO35473 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1dO35473 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1dO35473 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1dO35473 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1dO35473 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1dO35473 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1dO35473 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1dO35473 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1dO35473 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1dO35473 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1dO35473 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1dO35473 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1dO35473 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1dO35473 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1dO35473 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1dO35473 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1dO35473 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1dO35473 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C1dO35473 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1dO35473 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1dO35473 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
C1dO35473 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1dO35473 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1dO35473 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1dO35473 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1dO35473 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1dO35473 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1dO35473 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1dO35473 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1dO35473 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1dO35473 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1dO35473 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1dO35473 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1dO35473 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1dO35473 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1dO35473 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1dO35473 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1dO35473 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1dO35473 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1dO35473 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1dO35473 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1dO35473 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1dO35473 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1dO35473 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1dO35473 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1dO35473 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1dO35473 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C1dO35473 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1dO35473 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1dO35473 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1dO35473 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1dO35473 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1dO35473 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1dO35473 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1dO35473 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1dO35473 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1dO35473 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1dO35473 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1dO35473 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1dO35473 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1dO35473 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1dO35473 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1dO35473 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1dO35473 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1dO35473 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1dO35473 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1dO35473 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1dO35473 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1dO35473 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1dO35473 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms