Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clcn6O35454 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clcn6O35454 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clcn6O35454 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clcn6O35454 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clcn6O35454 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clcn6O35454 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Clcn6O35454 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clcn6O35454 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clcn6O35454 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clcn6O35454 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clcn6O35454 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clcn6O35454 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Clcn6O35454 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clcn6O35454 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clcn6O35454 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clcn6O35454 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clcn6O35454 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clcn6O35454 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clcn6O35454 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clcn6O35454 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clcn6O35454 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clcn6O35454 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clcn6O35454 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clcn6O35454 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clcn6O35454 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clcn6O35454 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clcn6O35454 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clcn6O35454 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clcn6O35454 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clcn6O35454 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clcn6O35454 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clcn6O35454 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clcn6O35454 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clcn6O35454 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clcn6O35454 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clcn6O35454 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clcn6O35454 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clcn6O35454 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clcn6O35454 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clcn6O35454 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clcn6O35454 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clcn6O35454 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clcn6O35454 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clcn6O35454 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clcn6O35454 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clcn6O35454 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clcn6O35454 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clcn6O35454 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clcn6O35454 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clcn6O35454 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clcn6O35454 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clcn6O35454 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clcn6O35454 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clcn6O35454 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clcn6O35454 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clcn6O35454 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Clcn6O35454 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clcn6O35454 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clcn6O35454 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clcn6O35454 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clcn6O35454 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Clcn6O35454 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clcn6O35454 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clcn6O35454 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clcn6O35454 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clcn6O35454 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Clcn6O35454 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clcn6O35454 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clcn6O35454 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clcn6O35454 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clcn6O35454 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clcn6O35454 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clcn6O35454 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clcn6O35454 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clcn6O35454 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Clcn6O35454 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clcn6O35454 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn6O35454 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn6O35454 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clcn6O35454 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clcn6O35454 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clcn6O35454 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clcn6O35454 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcn6O35454 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcn6O35454 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcn6O35454 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn6O35454 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn6O35454 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn6O35454 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn6O35454 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn6O35454 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn6O35454 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clcn6O35454 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clcn6O35454 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clcn6O35454 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcn6O35454 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcn6O35454 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcn6O35454 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcn6O35454 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms