Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppef2O35385 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppef2O35385 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppef2O35385 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppef2O35385 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppef2O35385 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppef2O35385 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppef2O35385 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppef2O35385 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppef2O35385 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppef2O35385 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ppef2O35385 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppef2O35385 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppef2O35385 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppef2O35385 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppef2O35385 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppef2O35385 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppef2O35385 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppef2O35385 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppef2O35385 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ppef2O35385 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppef2O35385 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppef2O35385 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppef2O35385 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppef2O35385 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppef2O35385 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppef2O35385 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppef2O35385 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppef2O35385 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppef2O35385 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppef2O35385 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppef2O35385 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppef2O35385 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ppef2O35385 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ppef2O35385 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ppef2O35385 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppef2O35385 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppef2O35385 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppef2O35385 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppef2O35385 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppef2O35385 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppef2O35385 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppef2O35385 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppef2O35385 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppef2O35385 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppef2O35385 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppef2O35385 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppef2O35385 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppef2O35385 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppef2O35385 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppef2O35385 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppef2O35385 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppef2O35385 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppef2O35385 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppef2O35385 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppef2O35385 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppef2O35385 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppef2O35385 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppef2O35385 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppef2O35385 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppef2O35385 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppef2O35385 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppef2O35385 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ppef2O35385 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppef2O35385 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppef2O35385 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppef2O35385 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppef2O35385 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppef2O35385 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppef2O35385 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppef2O35385 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppef2O35385 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppef2O35385 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ppef2O35385 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ppef2O35385 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppef2O35385 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppef2O35385 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppef2O35385 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppef2O35385 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppef2O35385 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppef2O35385 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppef2O35385 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppef2O35385 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppef2O35385 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppef2O35385 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppef2O35385 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppef2O35385 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppef2O35385 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppef2O35385 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppef2O35385 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppef2O35385 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppef2O35385 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppef2O35385 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppef2O35385 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppef2O35385 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppef2O35385 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppef2O35385 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppef2O35385 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppef2O35385 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppef2O35385 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms