Protein–RNA interactions for Protein: O19442

H2-M9, Histocompatibility 2, M region locus 9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M9O19442 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2-M9O19442 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
H2-M9O19442 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2-M9O19442 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2-M9O19442 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2-M9O19442 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2-M9O19442 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2-M9O19442 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2-M9O19442 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2-M9O19442 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2-M9O19442 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2-M9O19442 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2-M9O19442 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2-M9O19442 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
H2-M9O19442 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2-M9O19442 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2-M9O19442 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2-M9O19442 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2-M9O19442 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2-M9O19442 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2-M9O19442 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2-M9O19442 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2-M9O19442 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2-M9O19442 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2-M9O19442 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H2-M9O19442 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H2-M9O19442 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
H2-M9O19442 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H2-M9O19442 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2-M9O19442 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2-M9O19442 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2-M9O19442 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2-M9O19442 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2-M9O19442 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2-M9O19442 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
H2-M9O19442 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2-M9O19442 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
H2-M9O19442 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2-M9O19442 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2-M9O19442 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2-M9O19442 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2-M9O19442 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2-M9O19442 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2-M9O19442 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-M9O19442 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-M9O19442 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-M9O19442 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-M9O19442 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-M9O19442 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
H2-M9O19442 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2-M9O19442 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2-M9O19442 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2-M9O19442 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2-M9O19442 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
H2-M9O19442 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2-M9O19442 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2-M9O19442 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2-M9O19442 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2-M9O19442 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2-M9O19442 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2-M9O19442 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2-M9O19442 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2-M9O19442 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2-M9O19442 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2-M9O19442 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2-M9O19442 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2-M9O19442 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2-M9O19442 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2-M9O19442 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2-M9O19442 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2-M9O19442 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2-M9O19442 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
H2-M9O19442 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2-M9O19442 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
H2-M9O19442 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-M9O19442 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-M9O19442 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-M9O19442 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2-M9O19442 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2-M9O19442 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2-M9O19442 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2-M9O19442 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2-M9O19442 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
H2-M9O19442 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-M9O19442 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-M9O19442 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-M9O19442 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2-M9O19442 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2-M9O19442 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2-M9O19442 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2-M9O19442 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-M9O19442 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-M9O19442 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-M9O19442 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-M9O19442 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-M9O19442 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-M9O19442 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-M9O19442 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2-M9O19442 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2-M9O19442 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms