Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NumblO08919 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NumblO08919 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NumblO08919 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NumblO08919 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NumblO08919 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NumblO08919 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NumblO08919 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NumblO08919 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NumblO08919 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NumblO08919 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NumblO08919 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NumblO08919 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NumblO08919 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NumblO08919 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NumblO08919 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NumblO08919 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NumblO08919 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NumblO08919 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NumblO08919 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NumblO08919 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NumblO08919 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NumblO08919 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NumblO08919 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NumblO08919 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NumblO08919 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NumblO08919 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NumblO08919 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NumblO08919 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NumblO08919 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NumblO08919 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NumblO08919 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NumblO08919 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NumblO08919 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NumblO08919 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NumblO08919 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NumblO08919 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NumblO08919 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NumblO08919 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NumblO08919 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NumblO08919 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NumblO08919 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NumblO08919 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NumblO08919 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NumblO08919 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NumblO08919 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NumblO08919 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NumblO08919 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NumblO08919 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NumblO08919 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NumblO08919 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NumblO08919 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NumblO08919 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NumblO08919 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NumblO08919 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NumblO08919 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NumblO08919 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NumblO08919 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NumblO08919 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NumblO08919 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NumblO08919 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NumblO08919 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NumblO08919 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NumblO08919 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NumblO08919 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NumblO08919 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NumblO08919 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NumblO08919 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NumblO08919 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NumblO08919 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NumblO08919 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NumblO08919 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NumblO08919 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NumblO08919 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NumblO08919 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NumblO08919 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NumblO08919 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NumblO08919 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NumblO08919 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NumblO08919 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NumblO08919 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NumblO08919 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NumblO08919 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NumblO08919 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NumblO08919 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NumblO08919 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NumblO08919 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NumblO08919 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NumblO08919 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NumblO08919 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NumblO08919 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NumblO08919 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NumblO08919 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NumblO08919 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NumblO08919 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NumblO08919 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NumblO08919 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NumblO08919 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NumblO08919 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NumblO08919 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 589.4 ms