Protein–RNA interactions for Protein: O08746

Matn2, Matrilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn2O08746 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Matn2O08746 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Matn2O08746 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Matn2O08746 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Matn2O08746 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Matn2O08746 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Matn2O08746 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Matn2O08746 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Matn2O08746 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Matn2O08746 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Matn2O08746 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Matn2O08746 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Matn2O08746 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Matn2O08746 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Matn2O08746 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Matn2O08746 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Matn2O08746 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Matn2O08746 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Matn2O08746 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Matn2O08746 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Matn2O08746 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Matn2O08746 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Matn2O08746 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Matn2O08746 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Matn2O08746 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Matn2O08746 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Matn2O08746 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Matn2O08746 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Matn2O08746 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Matn2O08746 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Matn2O08746 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Matn2O08746 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Matn2O08746 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Matn2O08746 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Matn2O08746 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Matn2O08746 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Matn2O08746 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Matn2O08746 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Matn2O08746 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Matn2O08746 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Matn2O08746 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Matn2O08746 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Matn2O08746 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Matn2O08746 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Matn2O08746 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Matn2O08746 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Matn2O08746 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Matn2O08746 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Matn2O08746 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Matn2O08746 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Matn2O08746 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Matn2O08746 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Matn2O08746 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Matn2O08746 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Matn2O08746 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Matn2O08746 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Matn2O08746 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Matn2O08746 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Matn2O08746 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Matn2O08746 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Matn2O08746 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Matn2O08746 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Matn2O08746 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Matn2O08746 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matn2O08746 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matn2O08746 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matn2O08746 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Matn2O08746 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Matn2O08746 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Matn2O08746 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Matn2O08746 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Matn2O08746 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Matn2O08746 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Matn2O08746 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Matn2O08746 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Matn2O08746 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Matn2O08746 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Matn2O08746 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Matn2O08746 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Matn2O08746 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Matn2O08746 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Matn2O08746 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Matn2O08746 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Matn2O08746 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Matn2O08746 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Matn2O08746 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Matn2O08746 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Matn2O08746 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Matn2O08746 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Matn2O08746 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Matn2O08746 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Matn2O08746 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Matn2O08746 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Matn2O08746 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Matn2O08746 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Matn2O08746 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Matn2O08746 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Matn2O08746 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Matn2O08746 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Matn2O08746 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms