Protein–RNA interactions for Protein: O08643

Gzmm, Granzyme M, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmmO08643 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GzmmO08643 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GzmmO08643 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GzmmO08643 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GzmmO08643 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GzmmO08643 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GzmmO08643 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GzmmO08643 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GzmmO08643 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GzmmO08643 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GzmmO08643 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GzmmO08643 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GzmmO08643 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GzmmO08643 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GzmmO08643 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GzmmO08643 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GzmmO08643 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GzmmO08643 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GzmmO08643 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GzmmO08643 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GzmmO08643 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GzmmO08643 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GzmmO08643 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GzmmO08643 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GzmmO08643 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GzmmO08643 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GzmmO08643 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GzmmO08643 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GzmmO08643 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GzmmO08643 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GzmmO08643 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GzmmO08643 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GzmmO08643 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GzmmO08643 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GzmmO08643 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GzmmO08643 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GzmmO08643 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GzmmO08643 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GzmmO08643 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GzmmO08643 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GzmmO08643 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GzmmO08643 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GzmmO08643 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GzmmO08643 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GzmmO08643 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GzmmO08643 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GzmmO08643 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GzmmO08643 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GzmmO08643 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GzmmO08643 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GzmmO08643 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GzmmO08643 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GzmmO08643 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GzmmO08643 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GzmmO08643 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GzmmO08643 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GzmmO08643 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GzmmO08643 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GzmmO08643 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GzmmO08643 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GzmmO08643 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GzmmO08643 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GzmmO08643 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GzmmO08643 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GzmmO08643 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GzmmO08643 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GzmmO08643 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GzmmO08643 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GzmmO08643 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GzmmO08643 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GzmmO08643 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GzmmO08643 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GzmmO08643 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GzmmO08643 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GzmmO08643 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GzmmO08643 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GzmmO08643 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GzmmO08643 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GzmmO08643 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GzmmO08643 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GzmmO08643 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GzmmO08643 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GzmmO08643 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GzmmO08643 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GzmmO08643 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GzmmO08643 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GzmmO08643 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GzmmO08643 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GzmmO08643 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GzmmO08643 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GzmmO08643 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GzmmO08643 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GzmmO08643 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GzmmO08643 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GzmmO08643 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GzmmO08643 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GzmmO08643 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GzmmO08643 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GzmmO08643 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GzmmO08643 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms