Protein–RNA interactions for Protein: L7N2A2

Gm8906, Predicted gene 8906 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8906L7N2A2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8906L7N2A2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8906L7N2A2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8906L7N2A2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8906L7N2A2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8906L7N2A2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8906L7N2A2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8906L7N2A2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8906L7N2A2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8906L7N2A2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8906L7N2A2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8906L7N2A2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8906L7N2A2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8906L7N2A2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8906L7N2A2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8906L7N2A2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8906L7N2A2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8906L7N2A2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8906L7N2A2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8906L7N2A2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8906L7N2A2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8906L7N2A2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8906L7N2A2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8906L7N2A2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8906L7N2A2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8906L7N2A2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8906L7N2A2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8906L7N2A2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8906L7N2A2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8906L7N2A2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8906L7N2A2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8906L7N2A2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8906L7N2A2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8906L7N2A2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8906L7N2A2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8906L7N2A2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8906L7N2A2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8906L7N2A2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8906L7N2A2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8906L7N2A2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm8906L7N2A2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8906L7N2A2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8906L7N2A2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8906L7N2A2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8906L7N2A2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8906L7N2A2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8906L7N2A2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8906L7N2A2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8906L7N2A2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8906L7N2A2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8906L7N2A2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8906L7N2A2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm8906L7N2A2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8906L7N2A2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8906L7N2A2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8906L7N2A2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8906L7N2A2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8906L7N2A2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8906L7N2A2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8906L7N2A2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8906L7N2A2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8906L7N2A2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8906L7N2A2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8906L7N2A2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8906L7N2A2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8906L7N2A2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8906L7N2A2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8906L7N2A2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8906L7N2A2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8906L7N2A2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm8906L7N2A2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8906L7N2A2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8906L7N2A2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm8906L7N2A2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8906L7N2A2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8906L7N2A2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm8906L7N2A2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8906L7N2A2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm8906L7N2A2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms