Protein–RNA interactions for Protein: J3QP80

Gm5814, MCG15559, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5814J3QP80 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm5814J3QP80 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm5814J3QP80 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm5814J3QP80 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm5814J3QP80 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm5814J3QP80 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm5814J3QP80 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm5814J3QP80 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm5814J3QP80 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm5814J3QP80 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm5814J3QP80 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm5814J3QP80 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm5814J3QP80 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm5814J3QP80 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm5814J3QP80 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gm5814J3QP80 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gm5814J3QP80 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm5814J3QP80 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm5814J3QP80 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm5814J3QP80 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm5814J3QP80 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm5814J3QP80 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm5814J3QP80 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm5814J3QP80 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm5814J3QP80 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gm5814J3QP80 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm5814J3QP80 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm5814J3QP80 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm5814J3QP80 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm5814J3QP80 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm5814J3QP80 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm5814J3QP80 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm5814J3QP80 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm5814J3QP80 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm5814J3QP80 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm5814J3QP80 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm5814J3QP80 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm5814J3QP80 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm5814J3QP80 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm5814J3QP80 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm5814J3QP80 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm5814J3QP80 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm5814J3QP80 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm5814J3QP80 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm5814J3QP80 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm5814J3QP80 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm5814J3QP80 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm5814J3QP80 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm5814J3QP80 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm5814J3QP80 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm5814J3QP80 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm5814J3QP80 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm5814J3QP80 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm5814J3QP80 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm5814J3QP80 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm5814J3QP80 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm5814J3QP80 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm5814J3QP80 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm5814J3QP80 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm5814J3QP80 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm5814J3QP80 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm5814J3QP80 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm5814J3QP80 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm5814J3QP80 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm5814J3QP80 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm5814J3QP80 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm5814J3QP80 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm5814J3QP80 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm5814J3QP80 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm5814J3QP80 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm5814J3QP80 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm5814J3QP80 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm5814J3QP80 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm5814J3QP80 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm5814J3QP80 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm5814J3QP80 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm5814J3QP80 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm5814J3QP80 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm5814J3QP80 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm5814J3QP80 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm5814J3QP80 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm5814J3QP80 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm5814J3QP80 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm5814J3QP80 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm5814J3QP80 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm5814J3QP80 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm5814J3QP80 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm5814J3QP80 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm5814J3QP80 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm5814J3QP80 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm5814J3QP80 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm5814J3QP80 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm5814J3QP80 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm5814J3QP80 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm5814J3QP80 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm5814J3QP80 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5814J3QP80 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5814J3QP80 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5814J3QP80 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm5814J3QP80 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms