Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mfsd4b4J3QNS5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mfsd4b4J3QNS5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mfsd4b4J3QNS5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mfsd4b4J3QNS5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mfsd4b4J3QNS5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mfsd4b4J3QNS5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mfsd4b4J3QNS5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mfsd4b4J3QNS5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mfsd4b4J3QNS5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mfsd4b4J3QNS5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mfsd4b4J3QNS5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mfsd4b4J3QNS5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mfsd4b4J3QNS5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mfsd4b4J3QNS5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mfsd4b4J3QNS5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mfsd4b4J3QNS5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mfsd4b4J3QNS5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mfsd4b4J3QNS5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mfsd4b4J3QNS5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mfsd4b4J3QNS5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mfsd4b4J3QNS5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mfsd4b4J3QNS5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mfsd4b4J3QNS5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mfsd4b4J3QNS5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mfsd4b4J3QNS5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mfsd4b4J3QNS5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mfsd4b4J3QNS5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mfsd4b4J3QNS5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mfsd4b4J3QNS5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mfsd4b4J3QNS5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mfsd4b4J3QNS5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mfsd4b4J3QNS5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mfsd4b4J3QNS5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mfsd4b4J3QNS5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mfsd4b4J3QNS5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mfsd4b4J3QNS5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Mfsd4b4J3QNS5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mfsd4b4J3QNS5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mfsd4b4J3QNS5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mfsd4b4J3QNS5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mfsd4b4J3QNS5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mfsd4b4J3QNS5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Mfsd4b4J3QNS5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mfsd4b4J3QNS5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mfsd4b4J3QNS5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mfsd4b4J3QNS5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mfsd4b4J3QNS5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mfsd4b4J3QNS5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mfsd4b4J3QNS5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mfsd4b4J3QNS5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mfsd4b4J3QNS5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mfsd4b4J3QNS5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mfsd4b4J3QNS5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mfsd4b4J3QNS5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mfsd4b4J3QNS5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mfsd4b4J3QNS5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mfsd4b4J3QNS5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mfsd4b4J3QNS5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mfsd4b4J3QNS5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mfsd4b4J3QNS5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mfsd4b4J3QNS5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mfsd4b4J3QNS5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mfsd4b4J3QNS5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfsd4b4J3QNS5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfsd4b4J3QNS5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfsd4b4J3QNS5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfsd4b4J3QNS5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfsd4b4J3QNS5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfsd4b4J3QNS5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfsd4b4J3QNS5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfsd4b4J3QNS5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfsd4b4J3QNS5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms