Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm3336J3QMQ6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm3336J3QMQ6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm3336J3QMQ6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm3336J3QMQ6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm3336J3QMQ6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm3336J3QMQ6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm3336J3QMQ6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm3336J3QMQ6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm3336J3QMQ6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm3336J3QMQ6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm3336J3QMQ6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm3336J3QMQ6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm3336J3QMQ6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm3336J3QMQ6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm3336J3QMQ6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm3336J3QMQ6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3336J3QMQ6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3336J3QMQ6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3336J3QMQ6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3336J3QMQ6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3336J3QMQ6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3336J3QMQ6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm3336J3QMQ6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm3336J3QMQ6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm3336J3QMQ6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm3336J3QMQ6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm3336J3QMQ6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm3336J3QMQ6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm3336J3QMQ6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3336J3QMQ6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm3336J3QMQ6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm3336J3QMQ6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm3336J3QMQ6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm3336J3QMQ6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3336J3QMQ6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3336J3QMQ6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3336J3QMQ6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm3336J3QMQ6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3336J3QMQ6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3336J3QMQ6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3336J3QMQ6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3336J3QMQ6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3336J3QMQ6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm3336J3QMQ6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm3336J3QMQ6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3336J3QMQ6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3336J3QMQ6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3336J3QMQ6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm3336J3QMQ6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm3336J3QMQ6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm3336J3QMQ6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm3336J3QMQ6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm3336J3QMQ6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm3336J3QMQ6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm3336J3QMQ6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm3336J3QMQ6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm3336J3QMQ6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm3336J3QMQ6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3336J3QMQ6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3336J3QMQ6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3336J3QMQ6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3336J3QMQ6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3336J3QMQ6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3336J3QMQ6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3336J3QMQ6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm3336J3QMQ6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm3336J3QMQ6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm3336J3QMQ6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm3336J3QMQ6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm3336J3QMQ6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm3336J3QMQ6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm3336J3QMQ6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm3336J3QMQ6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm3336J3QMQ6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm3336J3QMQ6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm3336J3QMQ6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm3336J3QMQ6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm3336J3QMQ6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm3336J3QMQ6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm3336J3QMQ6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm3336J3QMQ6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm3336J3QMQ6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm3336J3QMQ6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm3336J3QMQ6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm3336J3QMQ6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm3336J3QMQ6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm3336J3QMQ6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm3336J3QMQ6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm3336J3QMQ6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm3336J3QMQ6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm3336J3QMQ6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm3336J3QMQ6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gm3336J3QMQ6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm3336J3QMQ6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3336J3QMQ6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3336J3QMQ6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3336J3QMQ6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
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