Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM8

Gm7971, Predicted gene 16429, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7971J3QMM8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm7971J3QMM8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm7971J3QMM8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm7971J3QMM8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm7971J3QMM8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm7971J3QMM8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm7971J3QMM8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm7971J3QMM8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm7971J3QMM8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm7971J3QMM8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm7971J3QMM8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm7971J3QMM8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm7971J3QMM8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm7971J3QMM8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm7971J3QMM8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm7971J3QMM8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm7971J3QMM8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm7971J3QMM8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm7971J3QMM8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm7971J3QMM8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm7971J3QMM8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm7971J3QMM8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm7971J3QMM8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm7971J3QMM8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm7971J3QMM8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm7971J3QMM8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm7971J3QMM8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm7971J3QMM8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm7971J3QMM8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm7971J3QMM8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm7971J3QMM8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm7971J3QMM8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm7971J3QMM8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm7971J3QMM8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm7971J3QMM8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm7971J3QMM8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm7971J3QMM8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm7971J3QMM8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm7971J3QMM8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm7971J3QMM8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm7971J3QMM8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm7971J3QMM8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm7971J3QMM8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm7971J3QMM8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm7971J3QMM8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm7971J3QMM8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm7971J3QMM8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm7971J3QMM8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm7971J3QMM8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm7971J3QMM8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm7971J3QMM8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm7971J3QMM8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm7971J3QMM8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm7971J3QMM8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm7971J3QMM8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm7971J3QMM8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm7971J3QMM8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm7971J3QMM8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm7971J3QMM8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm7971J3QMM8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm7971J3QMM8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm7971J3QMM8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm7971J3QMM8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm7971J3QMM8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm7971J3QMM8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm7971J3QMM8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm7971J3QMM8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm7971J3QMM8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm7971J3QMM8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm7971J3QMM8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm7971J3QMM8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm7971J3QMM8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm7971J3QMM8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm7971J3QMM8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm7971J3QMM8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm7971J3QMM8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm7971J3QMM8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm7971J3QMM8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm7971J3QMM8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm7971J3QMM8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm7971J3QMM8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm7971J3QMM8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm7971J3QMM8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm7971J3QMM8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm7971J3QMM8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm7971J3QMM8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm7971J3QMM8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm7971J3QMM8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm7971J3QMM8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm7971J3QMM8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm7971J3QMM8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm7971J3QMM8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm7971J3QMM8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm7971J3QMM8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm7971J3QMM8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm7971J3QMM8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms