Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20830J3KML6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20830J3KML6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20830J3KML6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20830J3KML6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20830J3KML6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20830J3KML6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20830J3KML6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20830J3KML6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20830J3KML6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20830J3KML6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20830J3KML6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20830J3KML6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20830J3KML6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20830J3KML6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20830J3KML6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20830J3KML6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20830J3KML6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20830J3KML6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20830J3KML6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20830J3KML6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20830J3KML6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20830J3KML6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20830J3KML6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20830J3KML6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20830J3KML6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20830J3KML6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20830J3KML6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20830J3KML6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20830J3KML6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20830J3KML6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20830J3KML6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20830J3KML6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20830J3KML6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20830J3KML6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20830J3KML6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20830J3KML6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20830J3KML6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20830J3KML6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20830J3KML6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20830J3KML6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20830J3KML6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20830J3KML6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20830J3KML6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20830J3KML6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20830J3KML6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20830J3KML6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20830J3KML6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20830J3KML6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20830J3KML6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20830J3KML6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20830J3KML6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20830J3KML6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20830J3KML6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20830J3KML6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm20830J3KML6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20830J3KML6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20830J3KML6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20830J3KML6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20830J3KML6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20830J3KML6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20830J3KML6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20830J3KML6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20830J3KML6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20830J3KML6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20830J3KML6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20830J3KML6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20830J3KML6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20830J3KML6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20830J3KML6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20830J3KML6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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