Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arfip1G5E8V9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arfip1G5E8V9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arfip1G5E8V9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arfip1G5E8V9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arfip1G5E8V9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arfip1G5E8V9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arfip1G5E8V9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arfip1G5E8V9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arfip1G5E8V9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arfip1G5E8V9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arfip1G5E8V9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arfip1G5E8V9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arfip1G5E8V9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arfip1G5E8V9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arfip1G5E8V9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Arfip1G5E8V9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Arfip1G5E8V9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arfip1G5E8V9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arfip1G5E8V9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arfip1G5E8V9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arfip1G5E8V9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arfip1G5E8V9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arfip1G5E8V9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arfip1G5E8V9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arfip1G5E8V9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arfip1G5E8V9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arfip1G5E8V9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arfip1G5E8V9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Arfip1G5E8V9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Arfip1G5E8V9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arfip1G5E8V9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arfip1G5E8V9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arfip1G5E8V9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arfip1G5E8V9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arfip1G5E8V9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arfip1G5E8V9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arfip1G5E8V9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arfip1G5E8V9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Arfip1G5E8V9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arfip1G5E8V9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Arfip1G5E8V9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arfip1G5E8V9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arfip1G5E8V9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arfip1G5E8V9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arfip1G5E8V9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arfip1G5E8V9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arfip1G5E8V9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Arfip1G5E8V9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arfip1G5E8V9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arfip1G5E8V9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arfip1G5E8V9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arfip1G5E8V9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arfip1G5E8V9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arfip1G5E8V9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Arfip1G5E8V9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arfip1G5E8V9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Arfip1G5E8V9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arfip1G5E8V9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Arfip1G5E8V9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Arfip1G5E8V9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arfip1G5E8V9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arfip1G5E8V9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arfip1G5E8V9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arfip1G5E8V9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arfip1G5E8V9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arfip1G5E8V9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arfip1G5E8V9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arfip1G5E8V9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arfip1G5E8V9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arfip1G5E8V9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arfip1G5E8V9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arfip1G5E8V9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arfip1G5E8V9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arfip1G5E8V9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arfip1G5E8V9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arfip1G5E8V9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arfip1G5E8V9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arfip1G5E8V9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arfip1G5E8V9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arfip1G5E8V9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms