Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zc3h12bG3X9I7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zc3h12bG3X9I7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zc3h12bG3X9I7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Zc3h12bG3X9I7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zc3h12bG3X9I7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zc3h12bG3X9I7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zc3h12bG3X9I7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zc3h12bG3X9I7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zc3h12bG3X9I7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zc3h12bG3X9I7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zc3h12bG3X9I7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zc3h12bG3X9I7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zc3h12bG3X9I7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zc3h12bG3X9I7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zc3h12bG3X9I7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zc3h12bG3X9I7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zc3h12bG3X9I7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zc3h12bG3X9I7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zc3h12bG3X9I7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zc3h12bG3X9I7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zc3h12bG3X9I7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zc3h12bG3X9I7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zc3h12bG3X9I7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zc3h12bG3X9I7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zc3h12bG3X9I7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zc3h12bG3X9I7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zc3h12bG3X9I7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zc3h12bG3X9I7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zc3h12bG3X9I7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zc3h12bG3X9I7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Zc3h12bG3X9I7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zc3h12bG3X9I7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zc3h12bG3X9I7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zc3h12bG3X9I7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zc3h12bG3X9I7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zc3h12bG3X9I7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zc3h12bG3X9I7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zc3h12bG3X9I7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zc3h12bG3X9I7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zc3h12bG3X9I7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zc3h12bG3X9I7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zc3h12bG3X9I7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zc3h12bG3X9I7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zc3h12bG3X9I7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zc3h12bG3X9I7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zc3h12bG3X9I7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zc3h12bG3X9I7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zc3h12bG3X9I7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zc3h12bG3X9I7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zc3h12bG3X9I7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zc3h12bG3X9I7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zc3h12bG3X9I7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zc3h12bG3X9I7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zc3h12bG3X9I7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zc3h12bG3X9I7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zc3h12bG3X9I7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Zc3h12bG3X9I7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zc3h12bG3X9I7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zc3h12bG3X9I7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zc3h12bG3X9I7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zc3h12bG3X9I7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zc3h12bG3X9I7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zc3h12bG3X9I7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Zc3h12bG3X9I7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zc3h12bG3X9I7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zc3h12bG3X9I7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zc3h12bG3X9I7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zc3h12bG3X9I7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zc3h12bG3X9I7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zc3h12bG3X9I7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zc3h12bG3X9I7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zc3h12bG3X9I7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zc3h12bG3X9I7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zc3h12bG3X9I7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zc3h12bG3X9I7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zc3h12bG3X9I7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zc3h12bG3X9I7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zc3h12bG3X9I7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zc3h12bG3X9I7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zc3h12bG3X9I7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zc3h12bG3X9I7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zc3h12bG3X9I7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zc3h12bG3X9I7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Zc3h12bG3X9I7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zc3h12bG3X9I7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zc3h12bG3X9I7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zc3h12bG3X9I7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Zc3h12bG3X9I7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zc3h12bG3X9I7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zc3h12bG3X9I7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zc3h12bG3X9I7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zc3h12bG3X9I7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zc3h12bG3X9I7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zc3h12bG3X9I7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zc3h12bG3X9I7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zc3h12bG3X9I7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zc3h12bG3X9I7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms