Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nkx1-1G3UXB3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Nkx1-1G3UXB3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nkx1-1G3UXB3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nkx1-1G3UXB3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nkx1-1G3UXB3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nkx1-1G3UXB3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nkx1-1G3UXB3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Nkx1-1G3UXB3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nkx1-1G3UXB3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nkx1-1G3UXB3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nkx1-1G3UXB3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nkx1-1G3UXB3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nkx1-1G3UXB3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nkx1-1G3UXB3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nkx1-1G3UXB3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nkx1-1G3UXB3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nkx1-1G3UXB3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nkx1-1G3UXB3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Nkx1-1G3UXB3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nkx1-1G3UXB3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nkx1-1G3UXB3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nkx1-1G3UXB3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nkx1-1G3UXB3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nkx1-1G3UXB3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nkx1-1G3UXB3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nkx1-1G3UXB3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nkx1-1G3UXB3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nkx1-1G3UXB3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nkx1-1G3UXB3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nkx1-1G3UXB3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nkx1-1G3UXB3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nkx1-1G3UXB3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nkx1-1G3UXB3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nkx1-1G3UXB3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nkx1-1G3UXB3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nkx1-1G3UXB3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nkx1-1G3UXB3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nkx1-1G3UXB3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nkx1-1G3UXB3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nkx1-1G3UXB3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nkx1-1G3UXB3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nkx1-1G3UXB3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nkx1-1G3UXB3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nkx1-1G3UXB3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nkx1-1G3UXB3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nkx1-1G3UXB3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nkx1-1G3UXB3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nkx1-1G3UXB3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nkx1-1G3UXB3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nkx1-1G3UXB3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nkx1-1G3UXB3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nkx1-1G3UXB3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nkx1-1G3UXB3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Nkx1-1G3UXB3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nkx1-1G3UXB3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nkx1-1G3UXB3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Nkx1-1G3UXB3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Nkx1-1G3UXB3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nkx1-1G3UXB3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Nkx1-1G3UXB3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Nkx1-1G3UXB3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nkx1-1G3UXB3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nkx1-1G3UXB3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nkx1-1G3UXB3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nkx1-1G3UXB3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nkx1-1G3UXB3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nkx1-1G3UXB3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nkx1-1G3UXB3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nkx1-1G3UXB3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nkx1-1G3UXB3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nkx1-1G3UXB3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nkx1-1G3UXB3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nkx1-1G3UXB3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nkx1-1G3UXB3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nkx1-1G3UXB3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nkx1-1G3UXB3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nkx1-1G3UXB3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nkx1-1G3UXB3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nkx1-1G3UXB3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nkx1-1G3UXB3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nkx1-1G3UXB3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nkx1-1G3UXB3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nkx1-1G3UXB3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nkx1-1G3UXB3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nkx1-1G3UXB3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Nkx1-1G3UXB3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Nkx1-1G3UXB3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nkx1-1G3UXB3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nkx1-1G3UXB3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nkx1-1G3UXB3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nkx1-1G3UXB3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nkx1-1G3UXB3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nkx1-1G3UXB3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nkx1-1G3UXB3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nkx1-1G3UXB3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nkx1-1G3UXB3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nkx1-1G3UXB3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nkx1-1G3UXB3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms