Protein–RNA interactions for Protein: G3UX18

Gm20726, Predicted gene, 20726, mousemouse

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20726G3UX18 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20726G3UX18 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20726G3UX18 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20726G3UX18 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20726G3UX18 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20726G3UX18 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20726G3UX18 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20726G3UX18 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20726G3UX18 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20726G3UX18 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20726G3UX18 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20726G3UX18 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20726G3UX18 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20726G3UX18 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20726G3UX18 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20726G3UX18 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20726G3UX18 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20726G3UX18 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20726G3UX18 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20726G3UX18 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20726G3UX18 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20726G3UX18 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20726G3UX18 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20726G3UX18 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20726G3UX18 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20726G3UX18 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20726G3UX18 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20726G3UX18 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20726G3UX18 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20726G3UX18 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20726G3UX18 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20726G3UX18 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20726G3UX18 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20726G3UX18 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20726G3UX18 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20726G3UX18 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20726G3UX18 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20726G3UX18 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20726G3UX18 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20726G3UX18 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20726G3UX18 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms