Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE2

F830016B08Rik, Interferon-gamma-inducible GTPase Ifgga4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F830016B08RikG3UWE2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
F830016B08RikG3UWE2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
F830016B08RikG3UWE2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
F830016B08RikG3UWE2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
F830016B08RikG3UWE2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
F830016B08RikG3UWE2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
F830016B08RikG3UWE2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
F830016B08RikG3UWE2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
F830016B08RikG3UWE2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
F830016B08RikG3UWE2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
F830016B08RikG3UWE2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
F830016B08RikG3UWE2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
F830016B08RikG3UWE2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
F830016B08RikG3UWE2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F830016B08RikG3UWE2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
F830016B08RikG3UWE2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F830016B08RikG3UWE2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F830016B08RikG3UWE2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F830016B08RikG3UWE2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F830016B08RikG3UWE2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F830016B08RikG3UWE2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F830016B08RikG3UWE2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F830016B08RikG3UWE2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F830016B08RikG3UWE2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F830016B08RikG3UWE2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
F830016B08RikG3UWE2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F830016B08RikG3UWE2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F830016B08RikG3UWE2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F830016B08RikG3UWE2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F830016B08RikG3UWE2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F830016B08RikG3UWE2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
F830016B08RikG3UWE2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F830016B08RikG3UWE2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F830016B08RikG3UWE2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
F830016B08RikG3UWE2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
F830016B08RikG3UWE2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F830016B08RikG3UWE2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F830016B08RikG3UWE2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F830016B08RikG3UWE2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F830016B08RikG3UWE2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
F830016B08RikG3UWE2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
F830016B08RikG3UWE2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
F830016B08RikG3UWE2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
F830016B08RikG3UWE2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
F830016B08RikG3UWE2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
F830016B08RikG3UWE2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
F830016B08RikG3UWE2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
F830016B08RikG3UWE2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
F830016B08RikG3UWE2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F830016B08RikG3UWE2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
F830016B08RikG3UWE2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F830016B08RikG3UWE2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
F830016B08RikG3UWE2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
F830016B08RikG3UWE2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
F830016B08RikG3UWE2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
F830016B08RikG3UWE2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
F830016B08RikG3UWE2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F830016B08RikG3UWE2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F830016B08RikG3UWE2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms