Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Srp72F8VQC1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srp72F8VQC1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srp72F8VQC1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srp72F8VQC1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srp72F8VQC1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srp72F8VQC1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srp72F8VQC1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srp72F8VQC1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Srp72F8VQC1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srp72F8VQC1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srp72F8VQC1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srp72F8VQC1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srp72F8VQC1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srp72F8VQC1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srp72F8VQC1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srp72F8VQC1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srp72F8VQC1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srp72F8VQC1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srp72F8VQC1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srp72F8VQC1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srp72F8VQC1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srp72F8VQC1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srp72F8VQC1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srp72F8VQC1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srp72F8VQC1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srp72F8VQC1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srp72F8VQC1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srp72F8VQC1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srp72F8VQC1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srp72F8VQC1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srp72F8VQC1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srp72F8VQC1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srp72F8VQC1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srp72F8VQC1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srp72F8VQC1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srp72F8VQC1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srp72F8VQC1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srp72F8VQC1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srp72F8VQC1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Srp72F8VQC1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srp72F8VQC1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srp72F8VQC1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srp72F8VQC1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srp72F8VQC1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srp72F8VQC1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srp72F8VQC1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srp72F8VQC1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srp72F8VQC1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srp72F8VQC1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srp72F8VQC1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Srp72F8VQC1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srp72F8VQC1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srp72F8VQC1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srp72F8VQC1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srp72F8VQC1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srp72F8VQC1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srp72F8VQC1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srp72F8VQC1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Srp72F8VQC1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srp72F8VQC1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Srp72F8VQC1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srp72F8VQC1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srp72F8VQC1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srp72F8VQC1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srp72F8VQC1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srp72F8VQC1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srp72F8VQC1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srp72F8VQC1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srp72F8VQC1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Srp72F8VQC1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Srp72F8VQC1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srp72F8VQC1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srp72F8VQC1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Srp72F8VQC1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Srp72F8VQC1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Srp72F8VQC1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Srp72F8VQC1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srp72F8VQC1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srp72F8VQC1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Srp72F8VQC1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Srp72F8VQC1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Srp72F8VQC1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srp72F8VQC1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srp72F8VQC1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srp72F8VQC1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Srp72F8VQC1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Srp72F8VQC1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srp72F8VQC1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srp72F8VQC1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srp72F8VQC1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srp72F8VQC1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srp72F8VQC1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srp72F8VQC1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srp72F8VQC1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srp72F8VQC1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srp72F8VQC1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srp72F8VQC1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srp72F8VQC1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srp72F8VQC1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms