Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M1F7CXU4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M1F7CXU4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M1F7CXU4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M1F7CXU4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M1F7CXU4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M1F7CXU4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M1F7CXU4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M1F7CXU4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M1F7CXU4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M1F7CXU4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M1F7CXU4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M1F7CXU4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M1F7CXU4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-M1F7CXU4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-M1F7CXU4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-M1F7CXU4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-M1F7CXU4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-M1F7CXU4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-M1F7CXU4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-M1F7CXU4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-M1F7CXU4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-M1F7CXU4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-M1F7CXU4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-M1F7CXU4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-M1F7CXU4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-M1F7CXU4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-M1F7CXU4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-M1F7CXU4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-M1F7CXU4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-M1F7CXU4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-M1F7CXU4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-M1F7CXU4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-M1F7CXU4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
H2-M1F7CXU4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2-M1F7CXU4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-M1F7CXU4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-M1F7CXU4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-M1F7CXU4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-M1F7CXU4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-M1F7CXU4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-M1F7CXU4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-M1F7CXU4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-M1F7CXU4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-M1F7CXU4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-M1F7CXU4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-M1F7CXU4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-M1F7CXU4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-M1F7CXU4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-M1F7CXU4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-M1F7CXU4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-M1F7CXU4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-M1F7CXU4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2-M1F7CXU4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-M1F7CXU4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-M1F7CXU4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-M1F7CXU4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-M1F7CXU4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-M1F7CXU4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-M1F7CXU4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-M1F7CXU4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-M1F7CXU4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-M1F7CXU4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-M1F7CXU4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
H2-M1F7CXU4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-M1F7CXU4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-M1F7CXU4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-M1F7CXU4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-M1F7CXU4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-M1F7CXU4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-M1F7CXU4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-M1F7CXU4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-M1F7CXU4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-M1F7CXU4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-M1F7CXU4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M1F7CXU4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M1F7CXU4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M1F7CXU4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M1F7CXU4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-M1F7CXU4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms