Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2564F6Z9S8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2564F6Z9S8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm2564F6Z9S8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm2564F6Z9S8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm2564F6Z9S8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm2564F6Z9S8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm2564F6Z9S8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm2564F6Z9S8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2564F6Z9S8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2564F6Z9S8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2564F6Z9S8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2564F6Z9S8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2564F6Z9S8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2564F6Z9S8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm2564F6Z9S8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2564F6Z9S8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm2564F6Z9S8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm2564F6Z9S8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm2564F6Z9S8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm2564F6Z9S8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm2564F6Z9S8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2564F6Z9S8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2564F6Z9S8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2564F6Z9S8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2564F6Z9S8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2564F6Z9S8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2564F6Z9S8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2564F6Z9S8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2564F6Z9S8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2564F6Z9S8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2564F6Z9S8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2564F6Z9S8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2564F6Z9S8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm2564F6Z9S8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm2564F6Z9S8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm2564F6Z9S8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm2564F6Z9S8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm2564F6Z9S8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm2564F6Z9S8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm2564F6Z9S8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm2564F6Z9S8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm2564F6Z9S8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm2564F6Z9S8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm2564F6Z9S8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm2564F6Z9S8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2564F6Z9S8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm2564F6Z9S8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm2564F6Z9S8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm2564F6Z9S8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm2564F6Z9S8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm2564F6Z9S8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm2564F6Z9S8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm2564F6Z9S8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm2564F6Z9S8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm2564F6Z9S8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm2564F6Z9S8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm2564F6Z9S8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2564F6Z9S8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2564F6Z9S8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm2564F6Z9S8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2564F6Z9S8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2564F6Z9S8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2564F6Z9S8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm2564F6Z9S8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm2564F6Z9S8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm2564F6Z9S8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm2564F6Z9S8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2564F6Z9S8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2564F6Z9S8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm2564F6Z9S8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm2564F6Z9S8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2564F6Z9S8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2564F6Z9S8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2564F6Z9S8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm2564F6Z9S8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2564F6Z9S8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2564F6Z9S8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2564F6Z9S8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2564F6Z9S8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm2564F6Z9S8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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