Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SmgcF6VRN1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SmgcF6VRN1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SmgcF6VRN1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SmgcF6VRN1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SmgcF6VRN1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SmgcF6VRN1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SmgcF6VRN1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SmgcF6VRN1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SmgcF6VRN1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SmgcF6VRN1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SmgcF6VRN1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SmgcF6VRN1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SmgcF6VRN1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SmgcF6VRN1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SmgcF6VRN1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SmgcF6VRN1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SmgcF6VRN1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SmgcF6VRN1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SmgcF6VRN1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SmgcF6VRN1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SmgcF6VRN1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SmgcF6VRN1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SmgcF6VRN1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SmgcF6VRN1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SmgcF6VRN1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SmgcF6VRN1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SmgcF6VRN1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SmgcF6VRN1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SmgcF6VRN1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SmgcF6VRN1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SmgcF6VRN1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SmgcF6VRN1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SmgcF6VRN1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SmgcF6VRN1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SmgcF6VRN1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SmgcF6VRN1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SmgcF6VRN1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SmgcF6VRN1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SmgcF6VRN1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SmgcF6VRN1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SmgcF6VRN1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SmgcF6VRN1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SmgcF6VRN1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SmgcF6VRN1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SmgcF6VRN1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SmgcF6VRN1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SmgcF6VRN1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SmgcF6VRN1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SmgcF6VRN1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SmgcF6VRN1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SmgcF6VRN1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SmgcF6VRN1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SmgcF6VRN1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SmgcF6VRN1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SmgcF6VRN1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SmgcF6VRN1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SmgcF6VRN1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SmgcF6VRN1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SmgcF6VRN1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SmgcF6VRN1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SmgcF6VRN1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SmgcF6VRN1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SmgcF6VRN1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SmgcF6VRN1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SmgcF6VRN1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SmgcF6VRN1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SmgcF6VRN1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SmgcF6VRN1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SmgcF6VRN1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SmgcF6VRN1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SmgcF6VRN1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SmgcF6VRN1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SmgcF6VRN1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SmgcF6VRN1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SmgcF6VRN1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SmgcF6VRN1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SmgcF6VRN1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SmgcF6VRN1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SmgcF6VRN1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SmgcF6VRN1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SmgcF6VRN1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SmgcF6VRN1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SmgcF6VRN1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SmgcF6VRN1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SmgcF6VRN1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SmgcF6VRN1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SmgcF6VRN1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SmgcF6VRN1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SmgcF6VRN1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SmgcF6VRN1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SmgcF6VRN1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SmgcF6VRN1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SmgcF6VRN1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SmgcF6VRN1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SmgcF6VRN1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SmgcF6VRN1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SmgcF6VRN1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SmgcF6VRN1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SmgcF6VRN1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms