Protein–RNA interactions for Protein: F6U8V3

H2-M11, Histocompatibility 2, M region locus 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M11F6U8V3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M11F6U8V3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M11F6U8V3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M11F6U8V3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M11F6U8V3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M11F6U8V3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M11F6U8V3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M11F6U8V3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M11F6U8V3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M11F6U8V3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M11F6U8V3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M11F6U8V3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M11F6U8V3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M11F6U8V3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M11F6U8V3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M11F6U8V3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M11F6U8V3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M11F6U8V3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-M11F6U8V3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-M11F6U8V3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M11F6U8V3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M11F6U8V3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M11F6U8V3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M11F6U8V3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M11F6U8V3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M11F6U8V3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M11F6U8V3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M11F6U8V3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M11F6U8V3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M11F6U8V3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-M11F6U8V3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-M11F6U8V3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-M11F6U8V3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-M11F6U8V3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-M11F6U8V3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-M11F6U8V3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-M11F6U8V3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-M11F6U8V3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-M11F6U8V3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-M11F6U8V3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-M11F6U8V3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-M11F6U8V3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-M11F6U8V3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M11F6U8V3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M11F6U8V3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M11F6U8V3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-M11F6U8V3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-M11F6U8V3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-M11F6U8V3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-M11F6U8V3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-M11F6U8V3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-M11F6U8V3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-M11F6U8V3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M11F6U8V3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M11F6U8V3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M11F6U8V3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M11F6U8V3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M11F6U8V3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-M11F6U8V3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-M11F6U8V3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-M11F6U8V3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M11F6U8V3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M11F6U8V3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M11F6U8V3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M11F6U8V3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M11F6U8V3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M11F6U8V3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M11F6U8V3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M11F6U8V3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M11F6U8V3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M11F6U8V3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M11F6U8V3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M11F6U8V3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M11F6U8V3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M11F6U8V3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M11F6U8V3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M11F6U8V3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M11F6U8V3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M11F6U8V3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-M11F6U8V3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-M11F6U8V3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms